Calcium in the structure of Solvated Refinement of Ca-Loaded Calbindin D9K (pdb 1b1g)

The binding sites of Calcium atom in the structure of Solvated Refinement of Ca-Loaded Calbindin D9K (pdb code 1b1g). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Calcium atom. The 1b1g structure was solved by J.KORDEL, D.A.PEARLMAN, W.J.CHAZIN, with NMR in Solution technique. Calcium Binding Sites: Calcium binding site 1 out of 2 in 1b1g Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Calcium in the PDB 1b1g. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Calcium atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Asp19, A: Pro20, A: Asn21, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Ala14, A: Ala15, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Asn21, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Glu60, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, A: Tyr13, A: Ala14, A: Ala15, A: Lys16, A: Glu17, A: Gly18, A: Asp19, A: Pro20, A: Asn21, A: Gln22, A: Leu23, A: Ser24, A: Glu27, conact list: Atom Atom Distance (A) Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca N A:Asn21 4.68 Ca H A:Asn21 4.46 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca N A:Asn21 4.68 Ca H A:Asn21 4.46 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 Ca O A:Tyr13 4.99 Ca O A:Ala14 2.35 Ca HB3 A:Ala14 4.58 Ca HA A:Ala14 3.95 Ca C A:Ala14 3.53 Ca CA A:Ala14 4.34 Ca N A:Ala15 4.50 Ca HA A:Ala15 4.00 Ca C A:Ala15 4.96 Ca CA A:Ala15 4.67 Ca N A:Lys16 4.73 Ca H A:Lys16 4.37 Ca N A:Glu17 4.47 Ca OE1 A:Glu17 4.21 Ca HG3 A:Glu17 3.59 Ca OE2 A:Glu17 2.27 Ca CD A:Glu17 3.30 Ca C A:Glu17 4.97 Ca CG A:Glu17 4.02 Ca CA A:Glu17 4.98 Ca HG2 A:Glu17 4.75 Ca H A:Glu17 3.64 Ca O A:Asp19 2.69 Ca HB2 A:Asp19 4.65 Ca N A:Asp19 4.14 Ca CB A:Asp19 3.62 Ca HB3 A:Asp19 3.14 Ca OD2 A:Asp19 2.26 Ca H A:Asp19 3.60 Ca OD1 A:Asp19 4.40 Ca C A:Asp19 3.58 Ca CG A:Asp19 3.30 Ca CA A:Asp19 3.98 Ca N A:Pro20 4.64 Ca C A:Pro20 4.92 Ca N A:Asn21 4.68 Ca H A:Asn21 4.46 Ca HB2 A:Gln22 4.09 Ca N A:Gln22 4.18 Ca CB A:Gln22 4.76 Ca C A:Gln22 3.55 Ca CA A:Gln22 4.36 Ca O A:Gln22 2.38 Ca H A:Gln22 3.58 Ca N A:Leu23 4.53 Ca CA A:Leu23 4.71 Ca HA A:Leu23 4.04 Ca HG A:Ser24 3.51 Ca N A:Ser24 4.53 Ca H A:Ser24 3.72 Ca OG A:Ser24 4.02 Ca HB2 A:Glu27 4.76 Ca OE1 A:Glu27 2.38 Ca HG3 A:Glu27 4.73 Ca HB3 A:Glu27 4.98 Ca OE2 A:Glu27 2.35 Ca CD A:Glu27 2.73 Ca CG A:Glu27 4.26 Ca HG2 A:Glu27 4.72 interactive model: Calcium binding site 2 out of 2 in 1b1g Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Calcium in the PDB 1b1g. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Calcium atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Ser62, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Ser62, A: Glu65, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Ser62, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Glu65, A: Gln22, A: Asp54, A: Lys55, A: Asn56, A: Gly57, A: Asp58, A: Gly59, A: Glu60, A: Val61, A: Ser62, A: Glu65, conact list: Atom Atom Distance (A) Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca H A:Ser62 4.93 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca H A:Ser62 4.93 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca H A:Ser62 4.93 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 Ca HB2 A:Asp54 4.63 Ca CB A:Asp54 4.41 Ca HA A:Asp54 4.33 Ca OD2 A:Asp54 2.25 Ca OD1 A:Asp54 3.22 Ca CG A:Asp54 3.05 Ca CA A:Asp54 4.90 Ca H A:Lys55 4.68 Ca H A:Asn56 4.87 Ca O A:Gly57 2.36 Ca N A:Gly57 4.58 Ca H A:Gly57 4.18 Ca C A:Gly57 3.36 Ca CA A:Gly57 4.12 Ca HA3 A:Gly57 3.77 Ca N A:Asp58 4.16 Ca H A:Asp58 3.88 Ca H A:Gly59 4.36 Ca N A:Glu60 4.52 Ca C A:Glu60 3.49 Ca CA A:Glu60 4.63 Ca O A:Glu60 2.36 Ca H A:Glu60 3.97 Ca N A:Val61 4.17 Ca C A:Val61 4.69 Ca CA A:Val61 4.10 Ca HA A:Val61 3.23 Ca HG23 A:Val61 4.84 Ca H A:Ser62 4.93 Ca OE1 A:Glu65 4.08 Ca HG3 A:Glu65 4.20 Ca OE2 A:Glu65 2.27 Ca CD A:Glu65 3.42 Ca CG A:Glu65 4.46 Ca HG2 A:Glu65 4.97 interactive model: