Atomistry » Calcium » PDB 5dzv-5egi » 5e1n
Atomistry »
  Calcium »
    PDB 5dzv-5egi »
      5e1n »

Calcium in PDB 5e1n: Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model

Protein crystallography data

The structure of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n was solved by J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å) 24.76 / 1.00
Space group P 1
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°) 25.036, 29.409, 52.793, 89.45, 86.29, 82.39
R / Rfree (%) 13.4 / 15

Calcium Binding Sites:

The binding sites of Calcium atom in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model (pdb code 5e1n). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Calcium atom.
In total 5 binding sites of Calcium where determined in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n:
Jump to Calcium binding site number: 1; 2; 3; 4; 5;

Calcium binding site 1 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 1 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 1 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca203

b:7.8
occ:1.00
O A:THR26 2.1 5.3 0.2
OD1 A:ASP20 2.3 7.0 0.5
OD1 A:ASP22 2.3 9.8 0.5
O A:THR26 2.3 8.5 0.4
OD1 A:ASP24 2.3 8.6 1.0
OD1 A:ASP20 2.3 8.0 0.5
O A:HOH411 2.4 11.9 1.0
OE2 A:GLU31 2.4 9.4 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.1 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.7 0.2
OE1 A:GLU31 2.4 8.9 0.4
O A:THR26 2.4 8.3 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.8 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.2 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 8.2 0.2
OD1 A:ASP22 2.5 9.3 0.5
OE2 A:GLU31 2.6 9.6 0.4
O A:THR26 2.7 7.0 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.4 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.8 0.2
CD A:GLU31 2.8 8.7 0.2
CD A:GLU31 2.9 8.6 0.4
HG1 A:THR26 3.1 11.8 0.2
C A:THR26 3.2 5.5 0.2
H A:THR26 3.2 6.9 0.2
H A:ASP24 3.3 10.5 0.5
HA A:ASP20 3.3 10.0 0.5
CG A:ASP24 3.3 8.7 1.0
CG A:ASP20 3.3 7.1 0.5
H A:ASP24 3.4 10.5 0.5
HG1 A:THR26 3.4 7.0 0.2
HA A:ASP20 3.4 10.7 0.5
CG A:ASP22 3.4 11.9 0.5
H A:ASP22 3.4 12.7 0.5
H A:THR26 3.4 8.5 0.2
H A:THR26 3.5 7.9 0.4
CG A:ASP20 3.5 8.2 0.5
OG1 A:THR26 3.5 9.9 0.2
C A:THR26 3.5 7.8 0.4
C A:THR26 3.6 7.2 0.2
H A:THR26 3.6 8.5 0.2
CG A:ASP22 3.6 8.6 0.5
HG1 A:THR26 3.7 12.1 0.2
HG1 A:THR26 3.7 11.4 0.4
H A:ASP22 3.7 12.1 0.5
C A:THR26 3.8 6.3 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.6 0.2
OG1 A:THR26 3.8 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.0 0.4
HA A:ILE27 3.9 8.9 0.2
N A:THR26 3.9 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.9 9.1 0.2
OD2 A:ASP24 4.0 9.9 1.0
CA A:THR26 4.0 5.8 0.2
OD2 A:ASP22 4.0 15.8 0.5
HG23 A:THR28 4.0 13.7 0.2
CA A:ASP20 4.1 8.3 0.5
OG1 A:THR26 4.1 9.5 0.4
CA A:ASP20 4.1 8.9 0.5
HG23 A:THR28 4.1 13.3 0.4
CB A:ASP20 4.1 8.8 0.5
HB2 A:ASP20 4.1 10.6 0.5
N A:ASP24 4.1 8.8 1.0
OD2 A:ASP22 4.1 10.7 0.5
H A:THR28 4.2 8.3 0.2
HG23 A:THR28 4.2 12.8 0.2
N A:THR26 4.2 7.1 0.2
HG23 A:THR28 4.2 9.5 0.2
H A:GLY23 4.2 12.0 0.5
HB3 A:ASP24 4.2 11.0 1.0
OD2 A:ASP20 4.2 7.8 0.5
N A:THR26 4.2 6.6 0.4
CG A:GLU31 4.2 9.7 0.2
OG1 A:THR26 4.2 10.1 0.2
N A:ASP22 4.2 10.6 0.5
N A:ILE27 4.2 6.6 0.2
CG A:GLU31 4.3 8.8 0.2
CB A:ASP24 4.3 9.2 1.0
CG A:GLU31 4.3 10.0 0.2
H A:LYS21 4.3 11.3 0.5
CB A:ASP20 4.3 8.4 0.5
OD2 A:ASP20 4.3 8.0 0.5
C A:ASP20 4.3 9.0 0.5
N A:THR26 4.3 7.1 0.2
H A:GLY23 4.4 7.9 0.5
H A:THR28 4.4 11.1 0.2
CA A:THR26 4.4 6.5 0.2
CB A:THR26 4.4 7.0 0.2
CG A:GLU31 4.4 8.8 0.4
CA A:THR26 4.4 7.4 0.4
H A:THR28 4.4 9.8 0.2
H A:THR28 4.4 9.5 0.4
N A:ASP22 4.4 10.1 0.5
C A:ASP20 4.4 9.2 0.5
N A:LYS21 4.5 9.4 0.5
N A:ILE27 4.5 7.6 0.2
O A:HOH457 4.5 12.1 0.5
N A:ILE27 4.5 7.7 0.4
N A:GLY23 4.5 10.0 0.5
HG3 A:GLU31 4.5 11.6 0.2
H A:GLY25 4.5 9.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.5 10.5 0.2
CB A:ASP22 4.6 11.9 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.6 0.2
H A:GLY25 4.6 9.6 0.2
CA A:ILE27 4.6 7.4 0.2
HG3 A:GLU31 4.6 12.1 0.2
HB2 A:ASP20 4.6 10.1 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.5 0.4
CA A:ASP24 4.6 8.9 1.0
H A:LYS21 4.6 11.9 0.5
CA A:THR26 4.6 7.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.6 11.6 0.2
CA A:ILE27 4.7 8.0 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 10.5 0.2
N A:GLY23 4.7 6.6 0.5
CA A:ASP22 4.7 11.2 0.5
N A:ILE27 4.7 6.9 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 12.1 0.2
H A:GLY25 4.7 8.8 0.4
H A:GLY25 4.7 10.2 0.2
N A:LYS21 4.7 9.9 0.5
C A:ASP22 4.7 10.2 0.5
CB A:THR26 4.7 4.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.7 10.5 0.4
N A:THR28 4.8 6.9 0.2
CB A:ASP22 4.8 9.7 0.5
O A:HOH331 4.8 21.8 1.0
N A:GLY25 4.8 8.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.8 10.5 0.4
N A:GLY25 4.8 8.0 0.2
O A:ASP20 4.9 10.1 0.5
HB3 A:ASP22 4.9 14.3 0.5
CB A:THR26 4.9 8.3 0.4
CA A:ASP22 4.9 9.0 0.5
N A:GLY25 4.9 8.5 0.2
N A:GLY25 4.9 7.3 0.4
HA A:THR26 4.9 7.0 0.2
HB2 A:GLU31 4.9 11.0 0.4
C A:ASP24 4.9 8.2 1.0
C A:ASP22 4.9 7.5 0.5
CG2 A:THR28 4.9 11.4 0.2
N A:THR28 4.9 9.2 0.2
O A:ASP20 5.0 10.0 0.5
HB2 A:GLU31 5.0 12.0 0.2
HB A:THR26 5.0 8.4 0.2

Calcium binding site 2 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 2 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 2 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca204

b:9.7
occ:1.00
OD1 A:ASN60 2.3 10.6 0.2
OD1 A:ASN60 2.3 10.1 0.5
OD1 A:ASP56 2.3 8.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.4 7.8 0.4
OD1 A:ASP58 2.4 7.8 0.4
O A:THR62 2.4 9.1 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 13.0 0.5
O A:HOH333 2.4 10.3 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 12.3 0.2
OD2 A:ASP58 2.4 13.3 0.2
OE1 A:GLU67 2.4 6.7 0.4
OD1 A:ASP58 2.5 10.9 0.5
OE1 A:GLU67 2.5 7.4 0.2
OE1 A:GLU67 2.5 10.8 0.4
OD1 A:ASN60 2.6 7.0 0.4
O A:HOH366 2.7 12.7 1.0
CD A:GLU67 2.7 6.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.8 7.5 0.2
OE2 A:GLU67 2.8 10.1 0.4
CD A:GLU67 3.0 6.9 0.2
CD A:GLU67 3.0 10.1 0.4
CG A:ASN60 3.3 11.3 0.2
CG A:ASN60 3.3 10.5 0.5
HD21 A:ASN60 3.3 14.5 1.0
CG A:ASP56 3.4 7.8 0.4
CG A:ASP58 3.4 13.9 0.2
CG A:ASN60 3.4 7.3 0.4
CG A:ASP58 3.4 8.7 0.4
CG A:ASP58 3.5 11.3 0.5
H A:ASP58 3.5 12.2 0.4
CG A:ASP56 3.6 11.5 0.2
C A:THR62 3.6 8.2 1.0
CG A:ASP56 3.6 11.8 0.5
H A:ASN60 3.6 12.6 0.5
HA A:ASP56 3.6 7.9 0.4
H A:ASP58 3.6 18.9 0.2
H A:ASN60 3.6 11.9 0.4
H A:THR62 3.6 11.3 0.5
H A:THR62 3.7 11.3 0.2
HA A:ILE63 3.7 9.5 1.0
H A:THR62 3.7 11.3 0.4
ND2 A:ASN60 3.7 12.1 0.2
ND2 A:ASN60 3.7 7.9 0.4
H A:ASN60 3.7 13.0 0.2
OD1 A:ASP58 3.8 13.6 0.2
H A:ASP58 3.8 15.4 0.5
OD2 A:ASP58 3.8 11.5 0.5
H A:ASP64 3.8 9.4 0.2
H A:ASP64 3.8 9.9 0.4
ND2 A:ASN60 3.9 10.5 0.5
H A:ASP64 3.9 9.3 0.4
HA A:ASP56 3.9 12.7 0.2
HA A:ASP56 3.9 14.6 0.5
OD2 A:ASP58 3.9 9.2 0.4
H A:GLY59 4.0 12.2 0.4
HD13 A:ILE63 4.1 12.1 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 12.2 0.2
CB A:ASP56 4.2 8.8 0.4
H A:ALA57 4.2 10.7 0.4
CA A:ASP56 4.2 6.6 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 8.3 0.4
HB2 A:ASP56 4.2 10.6 0.4
HG1 A:THR62 4.2 11.3 1.0
CG A:GLU67 4.3 8.9 0.4
N A:ASP58 4.3 10.2 0.4
H A:GLY59 4.3 19.2 0.2
N A:ASN60 4.3 10.5 0.5
N A:THR62 4.3 9.4 1.0
OD2 A:ASP56 4.3 11.8 0.5
CB A:ASN60 4.4 10.7 0.5
CA A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ASN60 4.4 9.9 0.4
N A:ASP58 4.4 15.8 0.2
C A:ASP56 4.4 7.5 0.4
N A:ASP64 4.4 7.8 0.2
N A:ASP64 4.4 8.3 0.4
N A:ALA57 4.4 8.9 0.4
HB3 A:ASN60 4.4 12.9 0.5
OD2 A:ASP64 4.4 9.4 0.2
H A:GLY61 4.5 12.8 0.5
CB A:ASP56 4.5 11.6 0.5
N A:ASP64 4.5 7.8 0.4
HB3 A:ASP64 4.5 11.4 0.4
OG1 A:THR62 4.5 9.4 1.0
HD22 A:ASN60 4.5 14.5 1.0
H A:GLY59 4.5 14.9 0.5
N A:ASP58 4.5 12.8 0.5
CG A:GLU67 4.5 10.1 0.4
CG A:GLU67 4.5 8.0 0.2
N A:GLY59 4.5 10.2 0.4
HB2 A:ASP56 4.5 13.9 0.5
CA A:THR62 4.5 8.8 1.0
CA A:ASP56 4.6 12.2 0.5
N A:ASN60 4.6 10.8 0.2
CB A:ASN60 4.6 10.6 0.2
HG3 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
OD2 A:ASP64 4.6 9.5 0.4
HB3 A:ASP64 4.6 8.9 0.2
CA A:ASP56 4.6 10.6 0.2
HG2 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
H A:GLY61 4.6 13.0 0.4
CB A:ASP56 4.6 11.1 0.2
CB A:ASP58 4.7 14.8 0.2
CB A:ASP58 4.7 9.1 0.4
H A:GLY61 4.7 10.4 0.2
CG A:ASP64 4.7 10.3 0.4
CA A:ASN60 4.7 11.3 0.5
CB A:ASN60 4.7 9.0 0.4
H A:ALA57 4.7 15.8 0.5
CB A:ASP58 4.7 11.4 0.5
CG A:ASP64 4.8 8.3 0.2
N A:GLY61 4.8 10.7 0.5
CA A:ASP58 4.8 10.6 0.4
HB3 A:ASN60 4.8 12.7 0.2
C A:ILE63 4.8 7.9 1.0
N A:GLY59 4.8 12.4 0.5
O A:HOH329 4.8 15.6 1.0
H A:ALA57 4.8 14.8 0.2
N A:GLY59 4.8 16.0 0.2
OD1 A:ASP64 4.8 12.6 0.4
HG3 A:GLU67 4.8 12.1 0.4
C A:ASP56 4.9 11.0 0.2
HG3 A:GLU67 4.9 9.5 0.2
CA A:ASP58 4.9 16.2 0.2
C A:ASP56 4.9 13.1 0.5
N A:ALA57 4.9 13.1 0.5
CG A:ASP64 4.9 11.0 0.4
HB2 A:GLU67 4.9 11.7 0.4
N A:ALA57 4.9 12.3 0.2
HB2 A:GLU67 4.9 10.4 0.2
CA A:ASN60 4.9 9.7 0.4
C A:ASN60 4.9 11.3 0.5
CA A:ASP58 5.0 12.8 0.5
OD2 A:ASP64 5.0 12.2 0.4
HB3 A:ASP64 5.0 12.5 0.4
CD1 A:ILE63 5.0 10.1 0.4
O A:ASP56 5.0 9.0 0.4
N A:GLY61 5.0 10.8 0.4
CA A:ASN60 5.0 11.3 0.2

Calcium binding site 3 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 3 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 3 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca205

b:12.1
occ:1.00
OD1 A:ASP129 2.2 10.6 0.4
O A:HIS135 2.2 10.4 0.2
O A:HIS135 2.2 10.4 0.3
OD1 A:ASP131 2.3 11.6 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 13.2 0.3
O A:HIS135 2.3 14.2 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 14.8 0.4
OD1 A:ASP133 2.3 15.1 0.2
OD1 A:ASP129 2.3 10.4 0.2
OD1 A:ASP131 2.4 13.5 0.4
OD1 A:ASP131 2.4 12.1 0.3
OD1 A:ASP131 2.4 18.1 0.2
O A:HOH350 2.4 15.1 1.0
OE1 A:GLU140 2.4 10.9 0.5
OD1 A:ASP129 2.5 8.5 0.3
OE1 A:GLU140 2.5 9.9 0.5
O A:HIS135 2.5 8.2 0.4
OD1 A:ASP129 2.5 16.2 0.2
OE2 A:GLU140 2.5 11.7 0.5
OD1 A:ASP133 2.5 11.7 0.2
OE2 A:GLU140 2.6 11.0 0.5
CD A:GLU140 2.8 12.3 0.5
CD A:GLU140 2.9 11.1 0.5
CG A:ASP131 3.1 11.9 0.2
OD2 A:ASP131 3.2 14.4 0.2
H A:ASP133 3.2 17.6 0.2
CG A:ASP131 3.2 18.0 0.2
CG A:ASP131 3.2 13.2 0.4
CG A:ASP133 3.2 14.8 0.4
CG A:ASP131 3.3 11.8 0.3
CG A:ASP133 3.3 14.0 0.3
CG A:ASP133 3.3 15.0 0.2
CG A:ASP129 3.3 10.8 0.4
H A:ASP133 3.4 17.2 0.3
HA A:ASP129 3.4 15.6 0.2
H A:ASP133 3.4 18.8 0.4
C A:HIS135 3.4 10.9 0.3
H A:HIS135 3.4 12.5 0.3
C A:HIS135 3.4 10.2 0.2
H A:HIS135 3.4 11.2 0.4
H A:HIS135 3.5 12.4 0.2
C A:HIS135 3.5 13.2 0.2
CG A:ASP129 3.5 11.2 0.2
H A:ASP131 3.5 15.3 0.4
CG A:ASP133 3.5 11.7 0.2
H A:ASP131 3.5 13.0 0.3
H A:HIS135 3.6 16.7 0.2
C A:HIS135 3.6 9.2 0.4
OD2 A:ASP131 3.6 18.7 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 11.4 0.3
H A:ASP133 3.6 16.9 0.2
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.3
CG A:ASP129 3.6 9.2 0.3
H A:ASP131 3.6 18.8 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 14.2 0.4
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.4
H A:ILE130 3.6 12.7 0.3
HA A:ILE136 3.7 12.6 0.3
HA A:ASP129 3.7 12.3 0.3
H A:ILE130 3.7 17.4 0.2
HA A:ASP129 3.7 15.7 0.2
OD2 A:ASP133 3.7 16.4 0.4
CG A:ASP129 3.7 15.1 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 14.7 0.3
H A:ASN137 3.8 13.3 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 15.6 0.2
H A:ILE130 3.8 13.9 0.4
H A:ASN137 3.8 13.9 0.8
H A:GLY132 3.8 20.5 0.2
H A:ASP131 3.8 16.6 0.2
HA A:ASP129 3.8 12.3 0.4
H A:GLY132 3.8 17.2 0.2
HD13 A:ILE136 3.8 13.1 0.3
OD2 A:ASP133 3.9 12.6 0.2
OD2 A:ASP129 3.9 10.8 0.4
H A:GLY132 4.0 17.8 0.4
N A:ASP133 4.1 14.6 0.2
HB2 A:HIS135 4.1 12.8 0.4
H A:GLY132 4.1 15.4 0.3
N A:HIS135 4.1 10.4 0.3
N A:ASP133 4.1 15.7 0.4
HD13 A:ILE136 4.1 14.4 0.4
HB2 A:HIS135 4.1 17.1 0.2
N A:HIS135 4.1 10.3 0.2
H A:GLY134 4.1 14.6 0.2
N A:ASP133 4.2 14.4 0.3
HB2 A:HIS135 4.2 14.3 0.3
N A:HIS135 4.2 9.3 0.4
N A:HIS135 4.2 13.9 0.2
CA A:ASP129 4.2 13.0 0.2
N A:ASP131 4.2 10.9 0.3
OD2 A:ASP129 4.2 11.1 0.2
N A:ASP131 4.2 12.7 0.4
HB2 A:HIS135 4.3 13.3 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.6 0.3
H A:ILE130 4.3 13.1 0.2
N A:ILE130 4.3 10.6 0.3
N A:ASP133 4.3 14.1 0.2
CG A:GLU140 4.3 11.2 0.5
N A:ILE136 4.3 10.8 1.0
CA A:HIS135 4.3 13.7 0.2
CB A:ASP133 4.3 15.7 0.2
N A:GLY132 4.3 17.1 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.2 0.2
N A:GLY132 4.3 14.4 0.2
CB A:ASP129 4.3 11.0 0.4
CB A:ASP133 4.4 14.7 0.3
N A:ASP131 4.4 15.7 0.2
CA A:ILE136 4.4 10.5 1.0
CG A:GLU140 4.4 9.6 0.5
H A:GLY134 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 9.4 0.3
CB A:ASP133 4.4 16.1 0.4
CA A:HIS135 4.4 9.7 0.4
H A:GLY134 4.4 15.9 0.3
CA A:ASP129 4.4 10.2 0.3
HB3 A:ASP133 4.4 18.9 0.2
N A:ASN137 4.4 11.1 0.2
CB A:ASP129 4.4 12.1 0.2
N A:ASN137 4.4 11.6 0.8
N A:GLY132 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 14.7 0.2
HB3 A:ASP133 4.5 17.7 0.3
N A:GLY132 4.5 12.9 0.3
CB A:ASP131 4.5 14.0 0.4
N A:ILE130 4.5 14.5 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.8 0.2
N A:ASP131 4.5 13.9 0.2
N A:ILE130 4.5 11.6 0.4
CA A:ASP129 4.5 10.3 0.4
CB A:ASP129 4.5 9.6 0.3
CB A:ASP131 4.5 17.7 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.3 0.3
HB3 A:ASN137 4.5 13.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.6 13.2 0.4
CA A:ASP129 4.6 13.1 0.2
CA A:ASP133 4.6 15.3 0.4
H A:GLY134 4.6 16.6 0.2
N A:GLY134 4.6 12.2 0.2
HB3 A:ASP133 4.6 19.3 0.4
CA A:ASP133 4.6 14.7 0.2
HB3 A:ASN137 4.6 16.9 0.8
CA A:ASP133 4.7 14.7 0.3
N A:GLY134 4.7 12.4 0.4
CA A:ASP131 4.7 14.3 0.4
HG3 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HB2 A:ASP129 4.7 11.6 0.3
HD22 A:LEU99 4.7 21.6 0.5
N A:GLY134 4.7 13.2 0.3
CA A:ASP131 4.7 11.9 0.3
CB A:HIS135 4.7 14.3 0.2
CB A:ASP133 4.7 12.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 10.6 0.4
CA A:ASP131 4.7 17.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 11.9 0.3
HG2 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HG2 A:GLU140 4.7 11.5 0.5
CD1 A:ILE136 4.7 10.9 0.3
C A:ASP129 4.8 11.9 0.3
CB A:ASP129 4.8 14.4 0.2
N A:ILE130 4.8 10.9 0.2
C A:ASP131 4.8 17.4 0.2
C A:ASP133 4.8 14.0 0.4
HB3 A:ASP131 4.8 16.8 0.4
C A:ASP131 4.8 12.8 0.3
HG3 A:GLU140 4.8 11.5 0.5
C A:ASP131 4.8 14.4 0.4
CB A:HIS135 4.8 11.1 0.2
CA A:ASP131 4.8 14.0 0.2
C A:ILE136 4.8 10.6 1.0
N A:GLY134 4.9 13.8 0.2
HD12 A:ILE136 4.9 13.1 0.3
HB3 A:ASP131 4.9 21.2 0.2
C A:ASP131 4.9 14.4 0.2
C A:ASP133 4.9 13.8 0.3
HB2 A:GLU140 4.9 14.2 0.5
C A:ASP129 4.9 14.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.9 14.5 0.2
HB2 A:GLU140 4.9 11.7 0.5
CA A:ASP133 4.9 13.2 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 19.8 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 20.8 0.3
C A:ASP133 4.9 14.1 0.2
HB3 A:ASP131 5.0 15.4 0.2
C A:ASP129 5.0 11.8 0.4
HB3 A:ASP133 5.0 14.6 0.2
HB2 A:ASP131 5.0 15.4 0.2

Calcium binding site 4 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 4 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 4 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca206

b:11.2
occ:1.00
OE2 A:GLU47 2.3 10.7 0.5
O A:HOH359 2.4 11.6 1.0
O A:HOH385 2.4 14.1 1.0
O A:HOH423 2.4 13.2 1.0
O A:HOH382 2.4 15.8 1.0
OE1 A:GLU47 2.5 8.8 0.5
OE1 A:GLU47 2.5 11.0 0.5
OE2 A:GLU47 2.7 14.1 0.5
CD A:GLU47 2.8 9.2 0.5
CD A:GLU47 2.9 11.2 0.5
HA A:PRO43 3.4 10.1 0.5
HG23 A:THR44 3.6 18.4 0.5
HA A:PRO43 3.7 8.0 0.5
H A:THR44 3.9 10.8 0.5
HG23 A:THR44 4.0 10.4 0.5
H A:THR44 4.1 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.3 8.7 0.5
CA A:PRO43 4.4 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.4 11.1 0.5
O A:ASN42 4.5 7.2 0.5
N A:THR44 4.5 9.0 0.5
HE21 A:GLN41 4.6 23.8 0.5
CG2 A:THR44 4.6 15.4 0.5
O A:HOH317 4.6 33.5 1.0
HG3 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
CA A:PRO43 4.6 6.7 0.5
HG2 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
HG3 A:GLU47 4.7 13.4 0.5
HG21 A:THR44 4.8 18.4 0.5
N A:THR44 4.8 7.0 0.5
HB3 A:PRO43 4.8 10.3 0.5
O A:HOH417 4.8 42.6 1.0
O A:HOH422 4.8 50.4 1.0
O A:HOH338 4.8 14.5 1.0
HG2 A:GLU47 4.9 13.4 0.5
HB3 A:PRO43 4.9 10.0 0.5
CG2 A:THR44 4.9 8.7 0.5
C A:PRO43 4.9 8.6 0.5
O A:ASN42 5.0 7.2 0.5
HB2 A:GLU47 5.0 12.2 0.5

Calcium binding site 5 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 5 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 5 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca207

b:13.3
occ:1.00
OD1 A:ASP93 2.2 14.0 0.4
O A:LEU99 2.2 13.3 0.5
OE1 A:GLU104 2.3 10.5 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 17.4 0.4
OD1 A:ASP93 2.3 13.1 0.3
OE2 A:GLU104 2.3 11.4 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 18.0 0.3
OD1 A:ASP95 2.4 17.3 0.2
O A:HOH401 2.4 21.1 1.0
OD1 A:ASN97 2.4 18.2 0.3
OD1 A:ASN97 2.4 17.0 0.7
OD1 A:ASP93 2.4 13.0 0.2
O A:LEU99 2.4 12.1 0.3
O A:LEU99 2.5 12.9 0.2
OE1 A:GLU104 2.5 10.4 0.6
CD A:GLU104 2.6 10.9 0.4
OE2 A:GLU104 2.7 11.6 0.6
CD A:GLU104 3.0 10.1 0.6
CG A:ASN97 3.3 19.6 0.3
CG A:ASP95 3.3 17.2 0.2
CG A:ASP95 3.3 17.5 0.3
CG A:ASP93 3.3 13.6 0.4
CG A:ASP95 3.3 18.2 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.2
H A:ASN97 3.4 23.3 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.3
H A:ASP95 3.4 17.6 0.4
H A:LEU99 3.4 17.1 0.3
H A:LEU99 3.4 18.0 0.2
C A:LEU99 3.4 12.7 0.5
CG A:ASN97 3.5 18.3 0.7
H A:ASP95 3.5 18.0 0.3
C A:LEU99 3.5 13.3 0.2
H A:ASP95 3.5 19.0 0.2
C A:LEU99 3.5 13.1 0.3
H A:LEU99 3.6 18.0 0.5
CG A:ASP93 3.6 13.4 0.3
HA A:ILE100 3.6 12.5 0.5
HA A:ASP93 3.6 15.0 0.4
OD2 A:ASP95 3.6 18.0 0.2
CG A:ASP93 3.6 13.5 0.2
HA A:ASP93 3.7 14.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.7 19.5 0.3
ND2 A:ASN97 3.7 20.1 0.3
H A:SER101 3.8 10.1 0.5
HA A:ASP93 3.8 14.7 0.2
HA A:ILE100 3.8 12.5 0.2
HA A:ILE100 3.9 10.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.9 20.8 0.4
H A:SER101 3.9 12.3 0.2
HB2 A:LEU99 4.0 16.7 0.5
HD21 A:ASN97 4.0 24.6 1.0
H A:GLY96 4.0 22.3 0.3
HB2 A:LEU99 4.0 17.8 0.3
HB2 A:LEU99 4.1 17.8 0.2
H A:ARG94 4.1 16.0 0.2
OD2 A:ASP93 4.1 14.0 0.4
H A:GLY96 4.1 22.8 0.2
N A:LEU99 4.1 14.3 0.3
CG A:GLU104 4.1 9.9 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.2
N A:ASN97 4.2 19.4 1.0
ND2 A:ASN97 4.2 20.5 0.7
N A:ASP95 4.2 14.7 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.5
H A:SER101 4.2 11.5 0.3
CA A:ASP93 4.2 12.5 0.4
CB A:ASP93 4.2 12.6 0.4
N A:ASP95 4.3 15.8 0.2
N A:ASP95 4.3 15.0 0.3
CA A:LEU99 4.3 14.1 0.2
C A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.6 0.5
CA A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.4 0.3
H A:GLY96 4.3 20.8 0.4
CA A:ILE100 4.4 10.4 0.5
N A:ILE100 4.4 11.7 0.2
CB A:ASP95 4.4 18.0 0.4
N A:ILE100 4.4 10.1 0.5
C A:ASP93 4.4 12.8 0.4
H A:ARG94 4.4 15.8 0.4
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.3
CB A:ASN97 4.4 21.8 0.3
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.2
N A:ILE100 4.4 10.7 0.3
N A:SER101 4.4 8.4 0.5
HB3 A:ASP95 4.4 21.6 0.4
H A:GLY98 4.4 21.8 0.3
HB2 A:ASP93 4.5 15.2 0.4
CB A:ASN97 4.5 22.6 0.7
N A:GLY96 4.5 18.6 0.3
N A:ARG94 4.5 13.3 0.2
CG A:GLU104 4.5 9.8 0.6
H A:GLY98 4.5 22.1 0.2
HB3 A:SER101 4.5 12.3 0.2
CA A:ASP93 4.5 12.3 0.2
N A:SER101 4.5 10.2 0.2
CA A:ILE100 4.5 10.4 0.2
HB3 A:ASN97 4.5 27.2 0.7
HG3 A:GLU104 4.5 11.9 0.4
N A:GLY96 4.5 19.0 0.2
H A:GLY98 4.5 21.4 0.5
CB A:ASP95 4.5 16.7 0.3
N A:ARG94 4.5 13.1 0.4
HB3 A:SER101 4.5 13.7 0.5
CB A:ASP93 4.5 12.7 0.3
HB3 A:ASN97 4.5 26.2 0.3
HG2 A:GLU104 4.6 11.9 0.4
CA A:ILE100 4.6 8.8 0.3
CB A:ASP93 4.6 12.9 0.2
CB A:ASP95 4.6 17.5 0.2
N A:GLY96 4.6 17.3 0.4
CB A:LEU99 4.6 13.9 0.5
H A:ARG94 4.6 13.9 0.3
O A:HOH381 4.6 29.5 1.0
CA A:ASP95 4.6 16.3 0.4
O A:ASP93 4.6 13.1 0.3
N A:ARG94 4.6 11.6 0.3
C A:ASP93 4.7 13.4 0.2
CA A:ASN97 4.7 21.7 1.0
HB3 A:SER101 4.7 12.0 0.3
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.2
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.3
CA A:ASP95 4.7 17.3 0.3
C A:ASP95 4.7 17.2 0.4
N A:SER101 4.7 9.6 0.3
OG A:SER101 4.7 9.7 0.2
HG3 A:GLU104 4.7 11.7 0.6
CA A:ASP95 4.8 17.9 0.2
HB2 A:ASP93 4.8 15.4 0.2
N A:GLY98 4.8 18.2 0.3
HG A:SER101 4.8 11.7 0.2
HD2 A:HIS135 4.8 14.2 0.2
N A:GLY98 4.8 18.4 0.2
C A:ASP95 4.8 18.3 0.3
HB2 A:GLU104 4.8 10.4 0.4
N A:GLY98 4.8 17.8 0.5
C A:ASP95 4.9 19.2 0.2
HD2 A:HIS135 4.9 15.2 0.3
HB3 A:ASP95 4.9 20.0 0.3
C A:ILE100 4.9 10.3 0.2
HB3 A:LEU99 4.9 16.7 0.5
C A:ILE100 4.9 9.5 0.5
HG2 A:GLU104 4.9 11.7 0.6
O A:ASP93 4.9 12.3 0.4
HD22 A:ASN97 4.9 24.6 1.0
HB2 A:ASP93 5.0 15.2 0.3
HD2 A:HIS135 5.0 18.4 0.2
C A:ASN97 5.0 20.4 1.0

Reference:

J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson. Atomic Resolution Experimental Phase Information Reveals Extensive Disorder and Bound 2-Methyl-2,4-Pentanediol in Ca(2+)-Calmodulin. Acta Crystallogr D Struct V. 72 83 2016BIOL.
ISSN: ISSN 2059-7983
PubMed: 26894537
DOI: 10.1107/S2059798315021609
Page generated: Sun Jul 14 18:12:34 2024

Last articles

Zn in 9JYW
Zn in 9IR4
Zn in 9IR3
Zn in 9GMX
Zn in 9GMW
Zn in 9JEJ
Zn in 9ERF
Zn in 9ERE
Zn in 9EGV
Zn in 9EGW
© Copyright 2008-2020 by atomistry.com
Home   |    Site Map   |    Copyright   |    Contact us   |    Privacy