Atomistry » Calcium » PDB 5dzw-5egt » 5e1n
Atomistry »
  Calcium »
    PDB 5dzw-5egt »
      5e1n »

Calcium in PDB 5e1n: Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model

Protein crystallography data

The structure of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n was solved by J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å) 24.76 / 1.00
Space group P 1
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°) 25.036, 29.409, 52.793, 89.45, 86.29, 82.39
R / Rfree (%) 13.4 / 15

Calcium Binding Sites:

The binding sites of Calcium atom in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model (pdb code 5e1n). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Calcium atom.
In total 5 binding sites of Calcium where determined in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n:
Jump to Calcium binding site number: 1; 2; 3; 4; 5;

Calcium binding site 1 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 1 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 1 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca203

b:7.8
occ:1.00
O A:THR26 2.1 5.3 0.2
OD1 A:ASP20 2.3 7.0 0.5
OD1 A:ASP22 2.3 9.8 0.5
O A:THR26 2.3 8.5 0.4
OD1 A:ASP24 2.3 8.6 1.0
OD1 A:ASP20 2.3 8.0 0.5
O A:HOH411 2.4 11.9 1.0
OE2 A:GLU31 2.4 9.4 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.1 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.7 0.2
OE1 A:GLU31 2.4 8.9 0.4
O A:THR26 2.4 8.3 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.8 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.2 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 8.2 0.2
OD1 A:ASP22 2.5 9.3 0.5
OE2 A:GLU31 2.6 9.6 0.4
O A:THR26 2.7 7.0 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.4 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.8 0.2
CD A:GLU31 2.8 8.7 0.2
CD A:GLU31 2.9 8.6 0.4
HG1 A:THR26 3.1 11.8 0.2
C A:THR26 3.2 5.5 0.2
H A:THR26 3.2 6.9 0.2
H A:ASP24 3.3 10.5 0.5
HA A:ASP20 3.3 10.0 0.5
CG A:ASP24 3.3 8.7 1.0
CG A:ASP20 3.3 7.1 0.5
H A:ASP24 3.4 10.5 0.5
HG1 A:THR26 3.4 7.0 0.2
HA A:ASP20 3.4 10.7 0.5
CG A:ASP22 3.4 11.9 0.5
H A:ASP22 3.4 12.7 0.5
H A:THR26 3.4 8.5 0.2
H A:THR26 3.5 7.9 0.4
CG A:ASP20 3.5 8.2 0.5
OG1 A:THR26 3.5 9.9 0.2
C A:THR26 3.5 7.8 0.4
C A:THR26 3.6 7.2 0.2
H A:THR26 3.6 8.5 0.2
CG A:ASP22 3.6 8.6 0.5
HG1 A:THR26 3.7 12.1 0.2
HG1 A:THR26 3.7 11.4 0.4
H A:ASP22 3.7 12.1 0.5
C A:THR26 3.8 6.3 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.6 0.2
OG1 A:THR26 3.8 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.0 0.4
HA A:ILE27 3.9 8.9 0.2
N A:THR26 3.9 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.9 9.1 0.2
OD2 A:ASP24 4.0 9.9 1.0
CA A:THR26 4.0 5.8 0.2
OD2 A:ASP22 4.0 15.8 0.5
HG23 A:THR28 4.0 13.7 0.2
CA A:ASP20 4.1 8.3 0.5
OG1 A:THR26 4.1 9.5 0.4
CA A:ASP20 4.1 8.9 0.5
HG23 A:THR28 4.1 13.3 0.4
CB A:ASP20 4.1 8.8 0.5
HB2 A:ASP20 4.1 10.6 0.5
N A:ASP24 4.1 8.8 1.0
OD2 A:ASP22 4.1 10.7 0.5
H A:THR28 4.2 8.3 0.2
HG23 A:THR28 4.2 12.8 0.2
N A:THR26 4.2 7.1 0.2
HG23 A:THR28 4.2 9.5 0.2
H A:GLY23 4.2 12.0 0.5
HB3 A:ASP24 4.2 11.0 1.0
OD2 A:ASP20 4.2 7.8 0.5
N A:THR26 4.2 6.6 0.4
CG A:GLU31 4.2 9.7 0.2
OG1 A:THR26 4.2 10.1 0.2
N A:ASP22 4.2 10.6 0.5
N A:ILE27 4.2 6.6 0.2
CG A:GLU31 4.3 8.8 0.2
CB A:ASP24 4.3 9.2 1.0
CG A:GLU31 4.3 10.0 0.2
H A:LYS21 4.3 11.3 0.5
CB A:ASP20 4.3 8.4 0.5
OD2 A:ASP20 4.3 8.0 0.5
C A:ASP20 4.3 9.0 0.5
N A:THR26 4.3 7.1 0.2
H A:GLY23 4.4 7.9 0.5
H A:THR28 4.4 11.1 0.2
CA A:THR26 4.4 6.5 0.2
CB A:THR26 4.4 7.0 0.2
CG A:GLU31 4.4 8.8 0.4
CA A:THR26 4.4 7.4 0.4
H A:THR28 4.4 9.8 0.2
H A:THR28 4.4 9.5 0.4
N A:ASP22 4.4 10.1 0.5
C A:ASP20 4.4 9.2 0.5
N A:LYS21 4.5 9.4 0.5
N A:ILE27 4.5 7.6 0.2
O A:HOH457 4.5 12.1 0.5
N A:ILE27 4.5 7.7 0.4
N A:GLY23 4.5 10.0 0.5
HG3 A:GLU31 4.5 11.6 0.2
H A:GLY25 4.5 9.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.5 10.5 0.2
CB A:ASP22 4.6 11.9 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.6 0.2
H A:GLY25 4.6 9.6 0.2
CA A:ILE27 4.6 7.4 0.2
HG3 A:GLU31 4.6 12.1 0.2
HB2 A:ASP20 4.6 10.1 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.5 0.4
CA A:ASP24 4.6 8.9 1.0
H A:LYS21 4.6 11.9 0.5
CA A:THR26 4.6 7.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.6 11.6 0.2
CA A:ILE27 4.7 8.0 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 10.5 0.2
N A:GLY23 4.7 6.6 0.5
CA A:ASP22 4.7 11.2 0.5
N A:ILE27 4.7 6.9 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 12.1 0.2
H A:GLY25 4.7 8.8 0.4
H A:GLY25 4.7 10.2 0.2
N A:LYS21 4.7 9.9 0.5
C A:ASP22 4.7 10.2 0.5
CB A:THR26 4.7 4.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.7 10.5 0.4
N A:THR28 4.8 6.9 0.2
CB A:ASP22 4.8 9.7 0.5
O A:HOH331 4.8 21.8 1.0
N A:GLY25 4.8 8.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.8 10.5 0.4
N A:GLY25 4.8 8.0 0.2
O A:ASP20 4.9 10.1 0.5
HB3 A:ASP22 4.9 14.3 0.5
CB A:THR26 4.9 8.3 0.4
CA A:ASP22 4.9 9.0 0.5
N A:GLY25 4.9 8.5 0.2
N A:GLY25 4.9 7.3 0.4
HA A:THR26 4.9 7.0 0.2
HB2 A:GLU31 4.9 11.0 0.4
C A:ASP24 4.9 8.2 1.0
C A:ASP22 4.9 7.5 0.5
CG2 A:THR28 4.9 11.4 0.2
N A:THR28 4.9 9.2 0.2
O A:ASP20 5.0 10.0 0.5
HB2 A:GLU31 5.0 12.0 0.2
HB A:THR26 5.0 8.4 0.2

Calcium binding site 2 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 2 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 2 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca204

b:9.7
occ:1.00
OD1 A:ASN60 2.3 10.6 0.2
OD1 A:ASN60 2.3 10.1 0.5
OD1 A:ASP56 2.3 8.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.4 7.8 0.4
OD1 A:ASP58 2.4 7.8 0.4
O A:THR62 2.4 9.1 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 13.0 0.5
O A:HOH333 2.4 10.3 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 12.3 0.2
OD2 A:ASP58 2.4 13.3 0.2
OE1 A:GLU67 2.4 6.7 0.4
OD1 A:ASP58 2.5 10.9 0.5
OE1 A:GLU67 2.5 7.4 0.2
OE1 A:GLU67 2.5 10.8 0.4
OD1 A:ASN60 2.6 7.0 0.4
O A:HOH366 2.7 12.7 1.0
CD A:GLU67 2.7 6.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.8 7.5 0.2
OE2 A:GLU67 2.8 10.1 0.4
CD A:GLU67 3.0 6.9 0.2
CD A:GLU67 3.0 10.1 0.4
CG A:ASN60 3.3 11.3 0.2
CG A:ASN60 3.3 10.5 0.5
HD21 A:ASN60 3.3 14.5 1.0
CG A:ASP56 3.4 7.8 0.4
CG A:ASP58 3.4 13.9 0.2
CG A:ASN60 3.4 7.3 0.4
CG A:ASP58 3.4 8.7 0.4
CG A:ASP58 3.5 11.3 0.5
H A:ASP58 3.5 12.2 0.4
CG A:ASP56 3.6 11.5 0.2
C A:THR62 3.6 8.2 1.0
CG A:ASP56 3.6 11.8 0.5
H A:ASN60 3.6 12.6 0.5
HA A:ASP56 3.6 7.9 0.4
H A:ASP58 3.6 18.9 0.2
H A:ASN60 3.6 11.9 0.4
H A:THR62 3.6 11.3 0.5
H A:THR62 3.7 11.3 0.2
HA A:ILE63 3.7 9.5 1.0
H A:THR62 3.7 11.3 0.4
ND2 A:ASN60 3.7 12.1 0.2
ND2 A:ASN60 3.7 7.9 0.4
H A:ASN60 3.7 13.0 0.2
OD1 A:ASP58 3.8 13.6 0.2
H A:ASP58 3.8 15.4 0.5
OD2 A:ASP58 3.8 11.5 0.5
H A:ASP64 3.8 9.4 0.2
H A:ASP64 3.8 9.9 0.4
ND2 A:ASN60 3.9 10.5 0.5
H A:ASP64 3.9 9.3 0.4
HA A:ASP56 3.9 12.7 0.2
HA A:ASP56 3.9 14.6 0.5
OD2 A:ASP58 3.9 9.2 0.4
H A:GLY59 4.0 12.2 0.4
HD13 A:ILE63 4.1 12.1 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 12.2 0.2
CB A:ASP56 4.2 8.8 0.4
H A:ALA57 4.2 10.7 0.4
CA A:ASP56 4.2 6.6 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 8.3 0.4
HB2 A:ASP56 4.2 10.6 0.4
HG1 A:THR62 4.2 11.3 1.0
CG A:GLU67 4.3 8.9 0.4
N A:ASP58 4.3 10.2 0.4
H A:GLY59 4.3 19.2 0.2
N A:ASN60 4.3 10.5 0.5
N A:THR62 4.3 9.4 1.0
OD2 A:ASP56 4.3 11.8 0.5
CB A:ASN60 4.4 10.7 0.5
CA A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ASN60 4.4 9.9 0.4
N A:ASP58 4.4 15.8 0.2
C A:ASP56 4.4 7.5 0.4
N A:ASP64 4.4 7.8 0.2
N A:ASP64 4.4 8.3 0.4
N A:ALA57 4.4 8.9 0.4
HB3 A:ASN60 4.4 12.9 0.5
OD2 A:ASP64 4.4 9.4 0.2
H A:GLY61 4.5 12.8 0.5
CB A:ASP56 4.5 11.6 0.5
N A:ASP64 4.5 7.8 0.4
HB3 A:ASP64 4.5 11.4 0.4
OG1 A:THR62 4.5 9.4 1.0
HD22 A:ASN60 4.5 14.5 1.0
H A:GLY59 4.5 14.9 0.5
N A:ASP58 4.5 12.8 0.5
CG A:GLU67 4.5 10.1 0.4
CG A:GLU67 4.5 8.0 0.2
N A:GLY59 4.5 10.2 0.4
HB2 A:ASP56 4.5 13.9 0.5
CA A:THR62 4.5 8.8 1.0
CA A:ASP56 4.6 12.2 0.5
N A:ASN60 4.6 10.8 0.2
CB A:ASN60 4.6 10.6 0.2
HG3 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
OD2 A:ASP64 4.6 9.5 0.4
HB3 A:ASP64 4.6 8.9 0.2
CA A:ASP56 4.6 10.6 0.2
HG2 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
H A:GLY61 4.6 13.0 0.4
CB A:ASP56 4.6 11.1 0.2
CB A:ASP58 4.7 14.8 0.2
CB A:ASP58 4.7 9.1 0.4
H A:GLY61 4.7 10.4 0.2
CG A:ASP64 4.7 10.3 0.4
CA A:ASN60 4.7 11.3 0.5
CB A:ASN60 4.7 9.0 0.4
H A:ALA57 4.7 15.8 0.5
CB A:ASP58 4.7 11.4 0.5
CG A:ASP64 4.8 8.3 0.2
N A:GLY61 4.8 10.7 0.5
CA A:ASP58 4.8 10.6 0.4
HB3 A:ASN60 4.8 12.7 0.2
C A:ILE63 4.8 7.9 1.0
N A:GLY59 4.8 12.4 0.5
O A:HOH329 4.8 15.6 1.0
H A:ALA57 4.8 14.8 0.2
N A:GLY59 4.8 16.0 0.2
OD1 A:ASP64 4.8 12.6 0.4
HG3 A:GLU67 4.8 12.1 0.4
C A:ASP56 4.9 11.0 0.2
HG3 A:GLU67 4.9 9.5 0.2
CA A:ASP58 4.9 16.2 0.2
C A:ASP56 4.9 13.1 0.5
N A:ALA57 4.9 13.1 0.5
CG A:ASP64 4.9 11.0 0.4
HB2 A:GLU67 4.9 11.7 0.4
N A:ALA57 4.9 12.3 0.2
HB2 A:GLU67 4.9 10.4 0.2
CA A:ASN60 4.9 9.7 0.4
C A:ASN60 4.9 11.3 0.5
CA A:ASP58 5.0 12.8 0.5
OD2 A:ASP64 5.0 12.2 0.4
HB3 A:ASP64 5.0 12.5 0.4
CD1 A:ILE63 5.0 10.1 0.4
O A:ASP56 5.0 9.0 0.4
N A:GLY61 5.0 10.8 0.4
CA A:ASN60 5.0 11.3 0.2

Calcium binding site 3 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 3 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 3 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca205

b:12.1
occ:1.00
OD1 A:ASP129 2.2 10.6 0.4
O A:HIS135 2.2 10.4 0.2
O A:HIS135 2.2 10.4 0.3
OD1 A:ASP131 2.3 11.6 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 13.2 0.3
O A:HIS135 2.3 14.2 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 14.8 0.4
OD1 A:ASP133 2.3 15.1 0.2
OD1 A:ASP129 2.3 10.4 0.2
OD1 A:ASP131 2.4 13.5 0.4
OD1 A:ASP131 2.4 12.1 0.3
OD1 A:ASP131 2.4 18.1 0.2
O A:HOH350 2.4 15.1 1.0
OE1 A:GLU140 2.4 10.9 0.5
OD1 A:ASP129 2.5 8.5 0.3
OE1 A:GLU140 2.5 9.9 0.5
O A:HIS135 2.5 8.2 0.4
OD1 A:ASP129 2.5 16.2 0.2
OE2 A:GLU140 2.5 11.7 0.5
OD1 A:ASP133 2.5 11.7 0.2
OE2 A:GLU140 2.6 11.0 0.5
CD A:GLU140 2.8 12.3 0.5
CD A:GLU140 2.9 11.1 0.5
CG A:ASP131 3.1 11.9 0.2
OD2 A:ASP131 3.2 14.4 0.2
H A:ASP133 3.2 17.6 0.2
CG A:ASP131 3.2 18.0 0.2
CG A:ASP131 3.2 13.2 0.4
CG A:ASP133 3.2 14.8 0.4
CG A:ASP131 3.3 11.8 0.3
CG A:ASP133 3.3 14.0 0.3
CG A:ASP133 3.3 15.0 0.2
CG A:ASP129 3.3 10.8 0.4
H A:ASP133 3.4 17.2 0.3
HA A:ASP129 3.4 15.6 0.2
H A:ASP133 3.4 18.8 0.4
C A:HIS135 3.4 10.9 0.3
H A:HIS135 3.4 12.5 0.3
C A:HIS135 3.4 10.2 0.2
H A:HIS135 3.4 11.2 0.4
H A:HIS135 3.5 12.4 0.2
C A:HIS135 3.5 13.2 0.2
CG A:ASP129 3.5 11.2 0.2
H A:ASP131 3.5 15.3 0.4
CG A:ASP133 3.5 11.7 0.2
H A:ASP131 3.5 13.0 0.3
H A:HIS135 3.6 16.7 0.2
C A:HIS135 3.6 9.2 0.4
OD2 A:ASP131 3.6 18.7 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 11.4 0.3
H A:ASP133 3.6 16.9 0.2
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.3
CG A:ASP129 3.6 9.2 0.3
H A:ASP131 3.6 18.8 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 14.2 0.4
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.4
H A:ILE130 3.6 12.7 0.3
HA A:ILE136 3.7 12.6 0.3
HA A:ASP129 3.7 12.3 0.3
H A:ILE130 3.7 17.4 0.2
HA A:ASP129 3.7 15.7 0.2
OD2 A:ASP133 3.7 16.4 0.4
CG A:ASP129 3.7 15.1 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 14.7 0.3
H A:ASN137 3.8 13.3 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 15.6 0.2
H A:ILE130 3.8 13.9 0.4
H A:ASN137 3.8 13.9 0.8
H A:GLY132 3.8 20.5 0.2
H A:ASP131 3.8 16.6 0.2
HA A:ASP129 3.8 12.3 0.4
H A:GLY132 3.8 17.2 0.2
HD13 A:ILE136 3.8 13.1 0.3
OD2 A:ASP133 3.9 12.6 0.2
OD2 A:ASP129 3.9 10.8 0.4
H A:GLY132 4.0 17.8 0.4
N A:ASP133 4.1 14.6 0.2
HB2 A:HIS135 4.1 12.8 0.4
H A:GLY132 4.1 15.4 0.3
N A:HIS135 4.1 10.4 0.3
N A:ASP133 4.1 15.7 0.4
HD13 A:ILE136 4.1 14.4 0.4
HB2 A:HIS135 4.1 17.1 0.2
N A:HIS135 4.1 10.3 0.2
H A:GLY134 4.1 14.6 0.2
N A:ASP133 4.2 14.4 0.3
HB2 A:HIS135 4.2 14.3 0.3
N A:HIS135 4.2 9.3 0.4
N A:HIS135 4.2 13.9 0.2
CA A:ASP129 4.2 13.0 0.2
N A:ASP131 4.2 10.9 0.3
OD2 A:ASP129 4.2 11.1 0.2
N A:ASP131 4.2 12.7 0.4
HB2 A:HIS135 4.3 13.3 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.6 0.3
H A:ILE130 4.3 13.1 0.2
N A:ILE130 4.3 10.6 0.3
N A:ASP133 4.3 14.1 0.2
CG A:GLU140 4.3 11.2 0.5
N A:ILE136 4.3 10.8 1.0
CA A:HIS135 4.3 13.7 0.2
CB A:ASP133 4.3 15.7 0.2
N A:GLY132 4.3 17.1 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.2 0.2
N A:GLY132 4.3 14.4 0.2
CB A:ASP129 4.3 11.0 0.4
CB A:ASP133 4.4 14.7 0.3
N A:ASP131 4.4 15.7 0.2
CA A:ILE136 4.4 10.5 1.0
CG A:GLU140 4.4 9.6 0.5
H A:GLY134 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 9.4 0.3
CB A:ASP133 4.4 16.1 0.4
CA A:HIS135 4.4 9.7 0.4
H A:GLY134 4.4 15.9 0.3
CA A:ASP129 4.4 10.2 0.3
HB3 A:ASP133 4.4 18.9 0.2
N A:ASN137 4.4 11.1 0.2
CB A:ASP129 4.4 12.1 0.2
N A:ASN137 4.4 11.6 0.8
N A:GLY132 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 14.7 0.2
HB3 A:ASP133 4.5 17.7 0.3
N A:GLY132 4.5 12.9 0.3
CB A:ASP131 4.5 14.0 0.4
N A:ILE130 4.5 14.5 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.8 0.2
N A:ASP131 4.5 13.9 0.2
N A:ILE130 4.5 11.6 0.4
CA A:ASP129 4.5 10.3 0.4
CB A:ASP129 4.5 9.6 0.3
CB A:ASP131 4.5 17.7 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.3 0.3
HB3 A:ASN137 4.5 13.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.6 13.2 0.4
CA A:ASP129 4.6 13.1 0.2
CA A:ASP133 4.6 15.3 0.4
H A:GLY134 4.6 16.6 0.2
N A:GLY134 4.6 12.2 0.2
HB3 A:ASP133 4.6 19.3 0.4
CA A:ASP133 4.6 14.7 0.2
HB3 A:ASN137 4.6 16.9 0.8
CA A:ASP133 4.7 14.7 0.3
N A:GLY134 4.7 12.4 0.4
CA A:ASP131 4.7 14.3 0.4
HG3 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HB2 A:ASP129 4.7 11.6 0.3
HD22 A:LEU99 4.7 21.6 0.5
N A:GLY134 4.7 13.2 0.3
CA A:ASP131 4.7 11.9 0.3
CB A:HIS135 4.7 14.3 0.2
CB A:ASP133 4.7 12.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 10.6 0.4
CA A:ASP131 4.7 17.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 11.9 0.3
HG2 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HG2 A:GLU140 4.7 11.5 0.5
CD1 A:ILE136 4.7 10.9 0.3
C A:ASP129 4.8 11.9 0.3
CB A:ASP129 4.8 14.4 0.2
N A:ILE130 4.8 10.9 0.2
C A:ASP131 4.8 17.4 0.2
C A:ASP133 4.8 14.0 0.4
HB3 A:ASP131 4.8 16.8 0.4
C A:ASP131 4.8 12.8 0.3
HG3 A:GLU140 4.8 11.5 0.5
C A:ASP131 4.8 14.4 0.4
CB A:HIS135 4.8 11.1 0.2
CA A:ASP131 4.8 14.0 0.2
C A:ILE136 4.8 10.6 1.0
N A:GLY134 4.9 13.8 0.2
HD12 A:ILE136 4.9 13.1 0.3
HB3 A:ASP131 4.9 21.2 0.2
C A:ASP131 4.9 14.4 0.2
C A:ASP133 4.9 13.8 0.3
HB2 A:GLU140 4.9 14.2 0.5
C A:ASP129 4.9 14.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.9 14.5 0.2
HB2 A:GLU140 4.9 11.7 0.5
CA A:ASP133 4.9 13.2 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 19.8 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 20.8 0.3
C A:ASP133 4.9 14.1 0.2
HB3 A:ASP131 5.0 15.4 0.2
C A:ASP129 5.0 11.8 0.4
HB3 A:ASP133 5.0 14.6 0.2
HB2 A:ASP131 5.0 15.4 0.2

Calcium binding site 4 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 4 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 4 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca206

b:11.2
occ:1.00
OE2 A:GLU47 2.3 10.7 0.5
O A:HOH359 2.4 11.6 1.0
O A:HOH385 2.4 14.1 1.0
O A:HOH423 2.4 13.2 1.0
O A:HOH382 2.4 15.8 1.0
OE1 A:GLU47 2.5 8.8 0.5
OE1 A:GLU47 2.5 11.0 0.5
OE2 A:GLU47 2.7 14.1 0.5
CD A:GLU47 2.8 9.2 0.5
CD A:GLU47 2.9 11.2 0.5
HA A:PRO43 3.4 10.1 0.5
HG23 A:THR44 3.6 18.4 0.5
HA A:PRO43 3.7 8.0 0.5
H A:THR44 3.9 10.8 0.5
HG23 A:THR44 4.0 10.4 0.5
H A:THR44 4.1 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.3 8.7 0.5
CA A:PRO43 4.4 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.4 11.1 0.5
O A:ASN42 4.5 7.2 0.5
N A:THR44 4.5 9.0 0.5
HE21 A:GLN41 4.6 23.8 0.5
CG2 A:THR44 4.6 15.4 0.5
O A:HOH317 4.6 33.5 1.0
HG3 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
CA A:PRO43 4.6 6.7 0.5
HG2 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
HG3 A:GLU47 4.7 13.4 0.5
HG21 A:THR44 4.8 18.4 0.5
N A:THR44 4.8 7.0 0.5
HB3 A:PRO43 4.8 10.3 0.5
O A:HOH417 4.8 42.6 1.0
O A:HOH422 4.8 50.4 1.0
O A:HOH338 4.8 14.5 1.0
HG2 A:GLU47 4.9 13.4 0.5
HB3 A:PRO43 4.9 10.0 0.5
CG2 A:THR44 4.9 8.7 0.5
C A:PRO43 4.9 8.6 0.5
O A:ASN42 5.0 7.2 0.5
HB2 A:GLU47 5.0 12.2 0.5

Calcium binding site 5 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 5 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 5 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca207

b:13.3
occ:1.00
OD1 A:ASP93 2.2 14.0 0.4
O A:LEU99 2.2 13.3 0.5
OE1 A:GLU104 2.3 10.5 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 17.4 0.4
OD1 A:ASP93 2.3 13.1 0.3
OE2 A:GLU104 2.3 11.4 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 18.0 0.3
OD1 A:ASP95 2.4 17.3 0.2
O A:HOH401 2.4 21.1 1.0
OD1 A:ASN97 2.4 18.2 0.3
OD1 A:ASN97 2.4 17.0 0.7
OD1 A:ASP93 2.4 13.0 0.2
O A:LEU99 2.4 12.1 0.3
O A:LEU99 2.5 12.9 0.2
OE1 A:GLU104 2.5 10.4 0.6
CD A:GLU104 2.6 10.9 0.4
OE2 A:GLU104 2.7 11.6 0.6
CD A:GLU104 3.0 10.1 0.6
CG A:ASN97 3.3 19.6 0.3
CG A:ASP95 3.3 17.2 0.2
CG A:ASP95 3.3 17.5 0.3
CG A:ASP93 3.3 13.6 0.4
CG A:ASP95 3.3 18.2 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.2
H A:ASN97 3.4 23.3 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.3
H A:ASP95 3.4 17.6 0.4
H A:LEU99 3.4 17.1 0.3
H A:LEU99 3.4 18.0 0.2
C A:LEU99 3.4 12.7 0.5
CG A:ASN97 3.5 18.3 0.7
H A:ASP95 3.5 18.0 0.3
C A:LEU99 3.5 13.3 0.2
H A:ASP95 3.5 19.0 0.2
C A:LEU99 3.5 13.1 0.3
H A:LEU99 3.6 18.0 0.5
CG A:ASP93 3.6 13.4 0.3
HA A:ILE100 3.6 12.5 0.5
HA A:ASP93 3.6 15.0 0.4
OD2 A:ASP95 3.6 18.0 0.2
CG A:ASP93 3.6 13.5 0.2
HA A:ASP93 3.7 14.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.7 19.5 0.3
ND2 A:ASN97 3.7 20.1 0.3
H A:SER101 3.8 10.1 0.5
HA A:ASP93 3.8 14.7 0.2
HA A:ILE100 3.8 12.5 0.2
HA A:ILE100 3.9 10.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.9 20.8 0.4
H A:SER101 3.9 12.3 0.2
HB2 A:LEU99 4.0 16.7 0.5
HD21 A:ASN97 4.0 24.6 1.0
H A:GLY96 4.0 22.3 0.3
HB2 A:LEU99 4.0 17.8 0.3
HB2 A:LEU99 4.1 17.8 0.2
H A:ARG94 4.1 16.0 0.2
OD2 A:ASP93 4.1 14.0 0.4
H A:GLY96 4.1 22.8 0.2
N A:LEU99 4.1 14.3 0.3
CG A:GLU104 4.1 9.9 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.2
N A:ASN97 4.2 19.4 1.0
ND2 A:ASN97 4.2 20.5 0.7
N A:ASP95 4.2 14.7 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.5
H A:SER101 4.2 11.5 0.3
CA A:ASP93 4.2 12.5 0.4
CB A:ASP93 4.2 12.6 0.4
N A:ASP95 4.3 15.8 0.2
N A:ASP95 4.3 15.0 0.3
CA A:LEU99 4.3 14.1 0.2
C A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.6 0.5
CA A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.4 0.3
H A:GLY96 4.3 20.8 0.4
CA A:ILE100 4.4 10.4 0.5
N A:ILE100 4.4 11.7 0.2
CB A:ASP95 4.4 18.0 0.4
N A:ILE100 4.4 10.1 0.5
C A:ASP93 4.4 12.8 0.4
H A:ARG94 4.4 15.8 0.4
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.3
CB A:ASN97 4.4 21.8 0.3
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.2
N A:ILE100 4.4 10.7 0.3
N A:SER101 4.4 8.4 0.5
HB3 A:ASP95 4.4 21.6 0.4
H A:GLY98 4.4 21.8 0.3
HB2 A:ASP93 4.5 15.2 0.4
CB A:ASN97 4.5 22.6 0.7
N A:GLY96 4.5 18.6 0.3
N A:ARG94 4.5 13.3 0.2
CG A:GLU104 4.5 9.8 0.6
H A:GLY98 4.5 22.1 0.2
HB3 A:SER101 4.5 12.3 0.2
CA A:ASP93 4.5 12.3 0.2
N A:SER101 4.5 10.2 0.2
CA A:ILE100 4.5 10.4 0.2
HB3 A:ASN97 4.5 27.2 0.7
HG3 A:GLU104 4.5 11.9 0.4
N A:GLY96 4.5 19.0 0.2
H A:GLY98 4.5 21.4 0.5
CB A:ASP95 4.5 16.7 0.3
N A:ARG94 4.5 13.1 0.4
HB3 A:SER101 4.5 13.7 0.5
CB A:ASP93 4.5 12.7 0.3
HB3 A:ASN97 4.5 26.2 0.3
HG2 A:GLU104 4.6 11.9 0.4
CA A:ILE100 4.6 8.8 0.3
CB A:ASP93 4.6 12.9 0.2
CB A:ASP95 4.6 17.5 0.2
N A:GLY96 4.6 17.3 0.4
CB A:LEU99 4.6 13.9 0.5
H A:ARG94 4.6 13.9 0.3
O A:HOH381 4.6 29.5 1.0
CA A:ASP95 4.6 16.3 0.4
O A:ASP93 4.6 13.1 0.3
N A:ARG94 4.6 11.6 0.3
C A:ASP93 4.7 13.4 0.2
CA A:ASN97 4.7 21.7 1.0
HB3 A:SER101 4.7 12.0 0.3
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.2
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.3
CA A:ASP95 4.7 17.3 0.3
C A:ASP95 4.7 17.2 0.4
N A:SER101 4.7 9.6 0.3
OG A:SER101 4.7 9.7 0.2
HG3 A:GLU104 4.7 11.7 0.6
CA A:ASP95 4.8 17.9 0.2
HB2 A:ASP93 4.8 15.4 0.2
N A:GLY98 4.8 18.2 0.3
HG A:SER101 4.8 11.7 0.2
HD2 A:HIS135 4.8 14.2 0.2
N A:GLY98 4.8 18.4 0.2
C A:ASP95 4.8 18.3 0.3
HB2 A:GLU104 4.8 10.4 0.4
N A:GLY98 4.8 17.8 0.5
C A:ASP95 4.9 19.2 0.2
HD2 A:HIS135 4.9 15.2 0.3
HB3 A:ASP95 4.9 20.0 0.3
C A:ILE100 4.9 10.3 0.2
HB3 A:LEU99 4.9 16.7 0.5
C A:ILE100 4.9 9.5 0.5
HG2 A:GLU104 4.9 11.7 0.6
O A:ASP93 4.9 12.3 0.4
HD22 A:ASN97 4.9 24.6 1.0
HB2 A:ASP93 5.0 15.2 0.3
HD2 A:HIS135 5.0 18.4 0.2
C A:ASN97 5.0 20.4 1.0

Reference:

J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson. Atomic Resolution Experimental Phase Information Reveals Extensive Disorder and Bound 2-Methyl-2,4-Pentanediol in Ca(2+)-Calmodulin. Acta Crystallogr D Struct V. 72 83 2016BIOL.
ISSN: ISSN 2059-7983
PubMed: 26894537
DOI: 10.1107/S2059798315021609
Page generated: Sun Jul 14 18:12:34 2024

Last articles

Zn in 9MJ5
Zn in 9HNW
Zn in 9G0L
Zn in 9FNE
Zn in 9DZN
Zn in 9E0I
Zn in 9D32
Zn in 9DAK
Zn in 8ZXC
Zn in 8ZUF
© Copyright 2008-2020 by atomistry.com
Home   |    Site Map   |    Copyright   |    Contact us   |    Privacy