Atomistry » Calcium » PDB 5dzw-5egt » 5e1n
Atomistry »
  Calcium »
    PDB 5dzw-5egt »
      5e1n »

Calcium in PDB 5e1n: Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model

Protein crystallography data

The structure of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n was solved by J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson, with X-Ray Crystallography technique. A brief refinement statistics is given in the table below:

Resolution Low / High (Å) 24.76 / 1.00
Space group P 1
Cell size a, b, c (Å), α, β, γ (°) 25.036, 29.409, 52.793, 89.45, 86.29, 82.39
R / Rfree (%) 13.4 / 15

Calcium Binding Sites:

The binding sites of Calcium atom in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model (pdb code 5e1n). This binding sites where shown within 5.0 Angstroms radius around Calcium atom.
In total 5 binding sites of Calcium where determined in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model, PDB code: 5e1n:
Jump to Calcium binding site number: 1; 2; 3; 4; 5;

Calcium binding site 1 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 1 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 1 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca203

b:7.8
occ:1.00
O A:THR26 2.1 5.3 0.2
OD1 A:ASP20 2.3 7.0 0.5
OD1 A:ASP22 2.3 9.8 0.5
O A:THR26 2.3 8.5 0.4
OD1 A:ASP24 2.3 8.6 1.0
OD1 A:ASP20 2.3 8.0 0.5
O A:HOH411 2.4 11.9 1.0
OE2 A:GLU31 2.4 9.4 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.1 0.2
OE2 A:GLU31 2.4 9.7 0.2
OE1 A:GLU31 2.4 8.9 0.4
O A:THR26 2.4 8.3 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.8 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 9.2 0.2
OE1 A:GLU31 2.5 8.2 0.2
OD1 A:ASP22 2.5 9.3 0.5
OE2 A:GLU31 2.6 9.6 0.4
O A:THR26 2.7 7.0 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.4 0.2
CD A:GLU31 2.8 9.8 0.2
CD A:GLU31 2.8 8.7 0.2
CD A:GLU31 2.9 8.6 0.4
HG1 A:THR26 3.1 11.8 0.2
C A:THR26 3.2 5.5 0.2
H A:THR26 3.2 6.9 0.2
H A:ASP24 3.3 10.5 0.5
HA A:ASP20 3.3 10.0 0.5
CG A:ASP24 3.3 8.7 1.0
CG A:ASP20 3.3 7.1 0.5
H A:ASP24 3.4 10.5 0.5
HG1 A:THR26 3.4 7.0 0.2
HA A:ASP20 3.4 10.7 0.5
CG A:ASP22 3.4 11.9 0.5
H A:ASP22 3.4 12.7 0.5
H A:THR26 3.4 8.5 0.2
H A:THR26 3.5 7.9 0.4
CG A:ASP20 3.5 8.2 0.5
OG1 A:THR26 3.5 9.9 0.2
C A:THR26 3.5 7.8 0.4
C A:THR26 3.6 7.2 0.2
H A:THR26 3.6 8.5 0.2
CG A:ASP22 3.6 8.6 0.5
HG1 A:THR26 3.7 12.1 0.2
HG1 A:THR26 3.7 11.4 0.4
H A:ASP22 3.7 12.1 0.5
C A:THR26 3.8 6.3 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.6 0.2
OG1 A:THR26 3.8 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.8 9.0 0.4
HA A:ILE27 3.9 8.9 0.2
N A:THR26 3.9 5.8 0.2
HA A:ILE27 3.9 9.1 0.2
OD2 A:ASP24 4.0 9.9 1.0
CA A:THR26 4.0 5.8 0.2
OD2 A:ASP22 4.0 15.8 0.5
HG23 A:THR28 4.0 13.7 0.2
CA A:ASP20 4.1 8.3 0.5
OG1 A:THR26 4.1 9.5 0.4
CA A:ASP20 4.1 8.9 0.5
HG23 A:THR28 4.1 13.3 0.4
CB A:ASP20 4.1 8.8 0.5
HB2 A:ASP20 4.1 10.6 0.5
N A:ASP24 4.1 8.8 1.0
OD2 A:ASP22 4.1 10.7 0.5
H A:THR28 4.2 8.3 0.2
HG23 A:THR28 4.2 12.8 0.2
N A:THR26 4.2 7.1 0.2
HG23 A:THR28 4.2 9.5 0.2
H A:GLY23 4.2 12.0 0.5
HB3 A:ASP24 4.2 11.0 1.0
OD2 A:ASP20 4.2 7.8 0.5
N A:THR26 4.2 6.6 0.4
CG A:GLU31 4.2 9.7 0.2
OG1 A:THR26 4.2 10.1 0.2
N A:ASP22 4.2 10.6 0.5
N A:ILE27 4.2 6.6 0.2
CG A:GLU31 4.3 8.8 0.2
CB A:ASP24 4.3 9.2 1.0
CG A:GLU31 4.3 10.0 0.2
H A:LYS21 4.3 11.3 0.5
CB A:ASP20 4.3 8.4 0.5
OD2 A:ASP20 4.3 8.0 0.5
C A:ASP20 4.3 9.0 0.5
N A:THR26 4.3 7.1 0.2
H A:GLY23 4.4 7.9 0.5
H A:THR28 4.4 11.1 0.2
CA A:THR26 4.4 6.5 0.2
CB A:THR26 4.4 7.0 0.2
CG A:GLU31 4.4 8.8 0.4
CA A:THR26 4.4 7.4 0.4
H A:THR28 4.4 9.8 0.2
H A:THR28 4.4 9.5 0.4
N A:ASP22 4.4 10.1 0.5
C A:ASP20 4.4 9.2 0.5
N A:LYS21 4.5 9.4 0.5
N A:ILE27 4.5 7.6 0.2
O A:HOH457 4.5 12.1 0.5
N A:ILE27 4.5 7.7 0.4
N A:GLY23 4.5 10.0 0.5
HG3 A:GLU31 4.5 11.6 0.2
H A:GLY25 4.5 9.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.5 10.5 0.2
CB A:ASP22 4.6 11.9 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.6 0.2
H A:GLY25 4.6 9.6 0.2
CA A:ILE27 4.6 7.4 0.2
HG3 A:GLU31 4.6 12.1 0.2
HB2 A:ASP20 4.6 10.1 0.5
CA A:ILE27 4.6 7.5 0.4
CA A:ASP24 4.6 8.9 1.0
H A:LYS21 4.6 11.9 0.5
CA A:THR26 4.6 7.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.6 11.6 0.2
CA A:ILE27 4.7 8.0 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 10.5 0.2
N A:GLY23 4.7 6.6 0.5
CA A:ASP22 4.7 11.2 0.5
N A:ILE27 4.7 6.9 0.2
HG2 A:GLU31 4.7 12.1 0.2
H A:GLY25 4.7 8.8 0.4
H A:GLY25 4.7 10.2 0.2
N A:LYS21 4.7 9.9 0.5
C A:ASP22 4.7 10.2 0.5
CB A:THR26 4.7 4.7 0.2
HG3 A:GLU31 4.7 10.5 0.4
N A:THR28 4.8 6.9 0.2
CB A:ASP22 4.8 9.7 0.5
O A:HOH331 4.8 21.8 1.0
N A:GLY25 4.8 8.1 0.2
HG2 A:GLU31 4.8 10.5 0.4
N A:GLY25 4.8 8.0 0.2
O A:ASP20 4.9 10.1 0.5
HB3 A:ASP22 4.9 14.3 0.5
CB A:THR26 4.9 8.3 0.4
CA A:ASP22 4.9 9.0 0.5
N A:GLY25 4.9 8.5 0.2
N A:GLY25 4.9 7.3 0.4
HA A:THR26 4.9 7.0 0.2
HB2 A:GLU31 4.9 11.0 0.4
C A:ASP24 4.9 8.2 1.0
C A:ASP22 4.9 7.5 0.5
CG2 A:THR28 4.9 11.4 0.2
N A:THR28 4.9 9.2 0.2
O A:ASP20 5.0 10.0 0.5
HB2 A:GLU31 5.0 12.0 0.2
HB A:THR26 5.0 8.4 0.2

Calcium binding site 2 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 2 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 2 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca204

b:9.7
occ:1.00
OD1 A:ASN60 2.3 10.6 0.2
OD1 A:ASN60 2.3 10.1 0.5
OD1 A:ASP56 2.3 8.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.4 7.8 0.4
OD1 A:ASP58 2.4 7.8 0.4
O A:THR62 2.4 9.1 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 13.0 0.5
O A:HOH333 2.4 10.3 1.0
OD1 A:ASP56 2.4 12.3 0.2
OD2 A:ASP58 2.4 13.3 0.2
OE1 A:GLU67 2.4 6.7 0.4
OD1 A:ASP58 2.5 10.9 0.5
OE1 A:GLU67 2.5 7.4 0.2
OE1 A:GLU67 2.5 10.8 0.4
OD1 A:ASN60 2.6 7.0 0.4
O A:HOH366 2.7 12.7 1.0
CD A:GLU67 2.7 6.8 0.4
OE2 A:GLU67 2.8 7.5 0.2
OE2 A:GLU67 2.8 10.1 0.4
CD A:GLU67 3.0 6.9 0.2
CD A:GLU67 3.0 10.1 0.4
CG A:ASN60 3.3 11.3 0.2
CG A:ASN60 3.3 10.5 0.5
HD21 A:ASN60 3.3 14.5 1.0
CG A:ASP56 3.4 7.8 0.4
CG A:ASP58 3.4 13.9 0.2
CG A:ASN60 3.4 7.3 0.4
CG A:ASP58 3.4 8.7 0.4
CG A:ASP58 3.5 11.3 0.5
H A:ASP58 3.5 12.2 0.4
CG A:ASP56 3.6 11.5 0.2
C A:THR62 3.6 8.2 1.0
CG A:ASP56 3.6 11.8 0.5
H A:ASN60 3.6 12.6 0.5
HA A:ASP56 3.6 7.9 0.4
H A:ASP58 3.6 18.9 0.2
H A:ASN60 3.6 11.9 0.4
H A:THR62 3.6 11.3 0.5
H A:THR62 3.7 11.3 0.2
HA A:ILE63 3.7 9.5 1.0
H A:THR62 3.7 11.3 0.4
ND2 A:ASN60 3.7 12.1 0.2
ND2 A:ASN60 3.7 7.9 0.4
H A:ASN60 3.7 13.0 0.2
OD1 A:ASP58 3.8 13.6 0.2
H A:ASP58 3.8 15.4 0.5
OD2 A:ASP58 3.8 11.5 0.5
H A:ASP64 3.8 9.4 0.2
H A:ASP64 3.8 9.9 0.4
ND2 A:ASN60 3.9 10.5 0.5
H A:ASP64 3.9 9.3 0.4
HA A:ASP56 3.9 12.7 0.2
HA A:ASP56 3.9 14.6 0.5
OD2 A:ASP58 3.9 9.2 0.4
H A:GLY59 4.0 12.2 0.4
HD13 A:ILE63 4.1 12.1 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 12.2 0.2
CB A:ASP56 4.2 8.8 0.4
H A:ALA57 4.2 10.7 0.4
CA A:ASP56 4.2 6.6 0.4
OD2 A:ASP56 4.2 8.3 0.4
HB2 A:ASP56 4.2 10.6 0.4
HG1 A:THR62 4.2 11.3 1.0
CG A:GLU67 4.3 8.9 0.4
N A:ASP58 4.3 10.2 0.4
H A:GLY59 4.3 19.2 0.2
N A:ASN60 4.3 10.5 0.5
N A:THR62 4.3 9.4 1.0
OD2 A:ASP56 4.3 11.8 0.5
CB A:ASN60 4.4 10.7 0.5
CA A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ILE63 4.4 8.0 1.0
N A:ASN60 4.4 9.9 0.4
N A:ASP58 4.4 15.8 0.2
C A:ASP56 4.4 7.5 0.4
N A:ASP64 4.4 7.8 0.2
N A:ASP64 4.4 8.3 0.4
N A:ALA57 4.4 8.9 0.4
HB3 A:ASN60 4.4 12.9 0.5
OD2 A:ASP64 4.4 9.4 0.2
H A:GLY61 4.5 12.8 0.5
CB A:ASP56 4.5 11.6 0.5
N A:ASP64 4.5 7.8 0.4
HB3 A:ASP64 4.5 11.4 0.4
OG1 A:THR62 4.5 9.4 1.0
HD22 A:ASN60 4.5 14.5 1.0
H A:GLY59 4.5 14.9 0.5
N A:ASP58 4.5 12.8 0.5
CG A:GLU67 4.5 10.1 0.4
CG A:GLU67 4.5 8.0 0.2
N A:GLY59 4.5 10.2 0.4
HB2 A:ASP56 4.5 13.9 0.5
CA A:THR62 4.5 8.8 1.0
CA A:ASP56 4.6 12.2 0.5
N A:ASN60 4.6 10.8 0.2
CB A:ASN60 4.6 10.6 0.2
HG3 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
OD2 A:ASP64 4.6 9.5 0.4
HB3 A:ASP64 4.6 8.9 0.2
CA A:ASP56 4.6 10.6 0.2
HG2 A:GLU67 4.6 10.7 0.4
H A:GLY61 4.6 13.0 0.4
CB A:ASP56 4.6 11.1 0.2
CB A:ASP58 4.7 14.8 0.2
CB A:ASP58 4.7 9.1 0.4
H A:GLY61 4.7 10.4 0.2
CG A:ASP64 4.7 10.3 0.4
CA A:ASN60 4.7 11.3 0.5
CB A:ASN60 4.7 9.0 0.4
H A:ALA57 4.7 15.8 0.5
CB A:ASP58 4.7 11.4 0.5
CG A:ASP64 4.8 8.3 0.2
N A:GLY61 4.8 10.7 0.5
CA A:ASP58 4.8 10.6 0.4
HB3 A:ASN60 4.8 12.7 0.2
C A:ILE63 4.8 7.9 1.0
N A:GLY59 4.8 12.4 0.5
O A:HOH329 4.8 15.6 1.0
H A:ALA57 4.8 14.8 0.2
N A:GLY59 4.8 16.0 0.2
OD1 A:ASP64 4.8 12.6 0.4
HG3 A:GLU67 4.8 12.1 0.4
C A:ASP56 4.9 11.0 0.2
HG3 A:GLU67 4.9 9.5 0.2
CA A:ASP58 4.9 16.2 0.2
C A:ASP56 4.9 13.1 0.5
N A:ALA57 4.9 13.1 0.5
CG A:ASP64 4.9 11.0 0.4
HB2 A:GLU67 4.9 11.7 0.4
N A:ALA57 4.9 12.3 0.2
HB2 A:GLU67 4.9 10.4 0.2
CA A:ASN60 4.9 9.7 0.4
C A:ASN60 4.9 11.3 0.5
CA A:ASP58 5.0 12.8 0.5
OD2 A:ASP64 5.0 12.2 0.4
HB3 A:ASP64 5.0 12.5 0.4
CD1 A:ILE63 5.0 10.1 0.4
O A:ASP56 5.0 9.0 0.4
N A:GLY61 5.0 10.8 0.4
CA A:ASN60 5.0 11.3 0.2

Calcium binding site 3 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 3 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 3 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca205

b:12.1
occ:1.00
OD1 A:ASP129 2.2 10.6 0.4
O A:HIS135 2.2 10.4 0.2
O A:HIS135 2.2 10.4 0.3
OD1 A:ASP131 2.3 11.6 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 13.2 0.3
O A:HIS135 2.3 14.2 0.2
OD1 A:ASP133 2.3 14.8 0.4
OD1 A:ASP133 2.3 15.1 0.2
OD1 A:ASP129 2.3 10.4 0.2
OD1 A:ASP131 2.4 13.5 0.4
OD1 A:ASP131 2.4 12.1 0.3
OD1 A:ASP131 2.4 18.1 0.2
O A:HOH350 2.4 15.1 1.0
OE1 A:GLU140 2.4 10.9 0.5
OD1 A:ASP129 2.5 8.5 0.3
OE1 A:GLU140 2.5 9.9 0.5
O A:HIS135 2.5 8.2 0.4
OD1 A:ASP129 2.5 16.2 0.2
OE2 A:GLU140 2.5 11.7 0.5
OD1 A:ASP133 2.5 11.7 0.2
OE2 A:GLU140 2.6 11.0 0.5
CD A:GLU140 2.8 12.3 0.5
CD A:GLU140 2.9 11.1 0.5
CG A:ASP131 3.1 11.9 0.2
OD2 A:ASP131 3.2 14.4 0.2
H A:ASP133 3.2 17.6 0.2
CG A:ASP131 3.2 18.0 0.2
CG A:ASP131 3.2 13.2 0.4
CG A:ASP133 3.2 14.8 0.4
CG A:ASP131 3.3 11.8 0.3
CG A:ASP133 3.3 14.0 0.3
CG A:ASP133 3.3 15.0 0.2
CG A:ASP129 3.3 10.8 0.4
H A:ASP133 3.4 17.2 0.3
HA A:ASP129 3.4 15.6 0.2
H A:ASP133 3.4 18.8 0.4
C A:HIS135 3.4 10.9 0.3
H A:HIS135 3.4 12.5 0.3
C A:HIS135 3.4 10.2 0.2
H A:HIS135 3.4 11.2 0.4
H A:HIS135 3.5 12.4 0.2
C A:HIS135 3.5 13.2 0.2
CG A:ASP129 3.5 11.2 0.2
H A:ASP131 3.5 15.3 0.4
CG A:ASP133 3.5 11.7 0.2
H A:ASP131 3.5 13.0 0.3
H A:HIS135 3.6 16.7 0.2
C A:HIS135 3.6 9.2 0.4
OD2 A:ASP131 3.6 18.7 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 11.4 0.3
H A:ASP133 3.6 16.9 0.2
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.3
CG A:ASP129 3.6 9.2 0.3
H A:ASP131 3.6 18.8 0.2
OD2 A:ASP131 3.6 14.2 0.4
HA A:ILE136 3.6 12.6 0.4
H A:ILE130 3.6 12.7 0.3
HA A:ILE136 3.7 12.6 0.3
HA A:ASP129 3.7 12.3 0.3
H A:ILE130 3.7 17.4 0.2
HA A:ASP129 3.7 15.7 0.2
OD2 A:ASP133 3.7 16.4 0.4
CG A:ASP129 3.7 15.1 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 14.7 0.3
H A:ASN137 3.8 13.3 0.2
OD2 A:ASP133 3.8 15.6 0.2
H A:ILE130 3.8 13.9 0.4
H A:ASN137 3.8 13.9 0.8
H A:GLY132 3.8 20.5 0.2
H A:ASP131 3.8 16.6 0.2
HA A:ASP129 3.8 12.3 0.4
H A:GLY132 3.8 17.2 0.2
HD13 A:ILE136 3.8 13.1 0.3
OD2 A:ASP133 3.9 12.6 0.2
OD2 A:ASP129 3.9 10.8 0.4
H A:GLY132 4.0 17.8 0.4
N A:ASP133 4.1 14.6 0.2
HB2 A:HIS135 4.1 12.8 0.4
H A:GLY132 4.1 15.4 0.3
N A:HIS135 4.1 10.4 0.3
N A:ASP133 4.1 15.7 0.4
HD13 A:ILE136 4.1 14.4 0.4
HB2 A:HIS135 4.1 17.1 0.2
N A:HIS135 4.1 10.3 0.2
H A:GLY134 4.1 14.6 0.2
N A:ASP133 4.2 14.4 0.3
HB2 A:HIS135 4.2 14.3 0.3
N A:HIS135 4.2 9.3 0.4
N A:HIS135 4.2 13.9 0.2
CA A:ASP129 4.2 13.0 0.2
N A:ASP131 4.2 10.9 0.3
OD2 A:ASP129 4.2 11.1 0.2
N A:ASP131 4.2 12.7 0.4
HB2 A:HIS135 4.3 13.3 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.6 0.3
H A:ILE130 4.3 13.1 0.2
N A:ILE130 4.3 10.6 0.3
N A:ASP133 4.3 14.1 0.2
CG A:GLU140 4.3 11.2 0.5
N A:ILE136 4.3 10.8 1.0
CA A:HIS135 4.3 13.7 0.2
CB A:ASP133 4.3 15.7 0.2
N A:GLY132 4.3 17.1 0.2
CA A:HIS135 4.3 10.2 0.2
N A:GLY132 4.3 14.4 0.2
CB A:ASP129 4.3 11.0 0.4
CB A:ASP133 4.4 14.7 0.3
N A:ASP131 4.4 15.7 0.2
CA A:ILE136 4.4 10.5 1.0
CG A:GLU140 4.4 9.6 0.5
H A:GLY134 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 9.4 0.3
CB A:ASP133 4.4 16.1 0.4
CA A:HIS135 4.4 9.7 0.4
H A:GLY134 4.4 15.9 0.3
CA A:ASP129 4.4 10.2 0.3
HB3 A:ASP133 4.4 18.9 0.2
N A:ASN137 4.4 11.1 0.2
CB A:ASP129 4.4 12.1 0.2
N A:ASN137 4.4 11.6 0.8
N A:GLY132 4.4 14.8 0.4
OD2 A:ASP129 4.4 14.7 0.2
HB3 A:ASP133 4.5 17.7 0.3
N A:GLY132 4.5 12.9 0.3
CB A:ASP131 4.5 14.0 0.4
N A:ILE130 4.5 14.5 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.8 0.2
N A:ASP131 4.5 13.9 0.2
N A:ILE130 4.5 11.6 0.4
CA A:ASP129 4.5 10.3 0.4
CB A:ASP129 4.5 9.6 0.3
CB A:ASP131 4.5 17.7 0.2
CB A:ASP131 4.5 12.3 0.3
HB3 A:ASN137 4.5 13.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.6 13.2 0.4
CA A:ASP129 4.6 13.1 0.2
CA A:ASP133 4.6 15.3 0.4
H A:GLY134 4.6 16.6 0.2
N A:GLY134 4.6 12.2 0.2
HB3 A:ASP133 4.6 19.3 0.4
CA A:ASP133 4.6 14.7 0.2
HB3 A:ASN137 4.6 16.9 0.8
CA A:ASP133 4.7 14.7 0.3
N A:GLY134 4.7 12.4 0.4
CA A:ASP131 4.7 14.3 0.4
HG3 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HB2 A:ASP129 4.7 11.6 0.3
HD22 A:LEU99 4.7 21.6 0.5
N A:GLY134 4.7 13.2 0.3
CA A:ASP131 4.7 11.9 0.3
CB A:HIS135 4.7 14.3 0.2
CB A:ASP133 4.7 12.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 10.6 0.4
CA A:ASP131 4.7 17.2 0.2
CB A:HIS135 4.7 11.9 0.3
HG2 A:GLU140 4.7 13.4 0.5
HG2 A:GLU140 4.7 11.5 0.5
CD1 A:ILE136 4.7 10.9 0.3
C A:ASP129 4.8 11.9 0.3
CB A:ASP129 4.8 14.4 0.2
N A:ILE130 4.8 10.9 0.2
C A:ASP131 4.8 17.4 0.2
C A:ASP133 4.8 14.0 0.4
HB3 A:ASP131 4.8 16.8 0.4
C A:ASP131 4.8 12.8 0.3
HG3 A:GLU140 4.8 11.5 0.5
C A:ASP131 4.8 14.4 0.4
CB A:HIS135 4.8 11.1 0.2
CA A:ASP131 4.8 14.0 0.2
C A:ILE136 4.8 10.6 1.0
N A:GLY134 4.9 13.8 0.2
HD12 A:ILE136 4.9 13.1 0.3
HB3 A:ASP131 4.9 21.2 0.2
C A:ASP131 4.9 14.4 0.2
C A:ASP133 4.9 13.8 0.3
HB2 A:GLU140 4.9 14.2 0.5
C A:ASP129 4.9 14.9 0.2
HB2 A:ASP129 4.9 14.5 0.2
HB2 A:GLU140 4.9 11.7 0.5
CA A:ASP133 4.9 13.2 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 19.8 0.2
HD22 A:LEU99 4.9 20.8 0.3
C A:ASP133 4.9 14.1 0.2
HB3 A:ASP131 5.0 15.4 0.2
C A:ASP129 5.0 11.8 0.4
HB3 A:ASP133 5.0 14.6 0.2
HB2 A:ASP131 5.0 15.4 0.2

Calcium binding site 4 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 4 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 4 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca206

b:11.2
occ:1.00
OE2 A:GLU47 2.3 10.7 0.5
O A:HOH359 2.4 11.6 1.0
O A:HOH385 2.4 14.1 1.0
O A:HOH423 2.4 13.2 1.0
O A:HOH382 2.4 15.8 1.0
OE1 A:GLU47 2.5 8.8 0.5
OE1 A:GLU47 2.5 11.0 0.5
OE2 A:GLU47 2.7 14.1 0.5
CD A:GLU47 2.8 9.2 0.5
CD A:GLU47 2.9 11.2 0.5
HA A:PRO43 3.4 10.1 0.5
HG23 A:THR44 3.6 18.4 0.5
HA A:PRO43 3.7 8.0 0.5
H A:THR44 3.9 10.8 0.5
HG23 A:THR44 4.0 10.4 0.5
H A:THR44 4.1 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.3 8.7 0.5
CA A:PRO43 4.4 8.4 0.5
CG A:GLU47 4.4 11.1 0.5
O A:ASN42 4.5 7.2 0.5
N A:THR44 4.5 9.0 0.5
HE21 A:GLN41 4.6 23.8 0.5
CG2 A:THR44 4.6 15.4 0.5
O A:HOH317 4.6 33.5 1.0
HG3 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
CA A:PRO43 4.6 6.7 0.5
HG2 A:GLU47 4.6 10.4 0.5
HG3 A:GLU47 4.7 13.4 0.5
HG21 A:THR44 4.8 18.4 0.5
N A:THR44 4.8 7.0 0.5
HB3 A:PRO43 4.8 10.3 0.5
O A:HOH417 4.8 42.6 1.0
O A:HOH422 4.8 50.4 1.0
O A:HOH338 4.8 14.5 1.0
HG2 A:GLU47 4.9 13.4 0.5
HB3 A:PRO43 4.9 10.0 0.5
CG2 A:THR44 4.9 8.7 0.5
C A:PRO43 4.9 8.6 0.5
O A:ASN42 5.0 7.2 0.5
HB2 A:GLU47 5.0 12.2 0.5

Calcium binding site 5 out of 5 in 5e1n

Go back to Calcium Binding Sites List in 5e1n
Calcium binding site 5 out of 5 in the Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model


Mono view


Stereo pair view

A full contact list of Calcium with other atoms in the Ca binding site number 5 of Selenomethionine CA2+-Calmodulin From Paramecium Tetraurelia Qfit Disorder Model within 5.0Å range:
probe atom residue distance (Å) B Occ
A:Ca207

b:13.3
occ:1.00
OD1 A:ASP93 2.2 14.0 0.4
O A:LEU99 2.2 13.3 0.5
OE1 A:GLU104 2.3 10.5 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 17.4 0.4
OD1 A:ASP93 2.3 13.1 0.3
OE2 A:GLU104 2.3 11.4 0.4
OD1 A:ASP95 2.3 18.0 0.3
OD1 A:ASP95 2.4 17.3 0.2
O A:HOH401 2.4 21.1 1.0
OD1 A:ASN97 2.4 18.2 0.3
OD1 A:ASN97 2.4 17.0 0.7
OD1 A:ASP93 2.4 13.0 0.2
O A:LEU99 2.4 12.1 0.3
O A:LEU99 2.5 12.9 0.2
OE1 A:GLU104 2.5 10.4 0.6
CD A:GLU104 2.6 10.9 0.4
OE2 A:GLU104 2.7 11.6 0.6
CD A:GLU104 3.0 10.1 0.6
CG A:ASN97 3.3 19.6 0.3
CG A:ASP95 3.3 17.2 0.2
CG A:ASP95 3.3 17.5 0.3
CG A:ASP93 3.3 13.6 0.4
CG A:ASP95 3.3 18.2 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.2
H A:ASN97 3.4 23.3 0.4
H A:ASN97 3.4 23.3 0.3
H A:ASP95 3.4 17.6 0.4
H A:LEU99 3.4 17.1 0.3
H A:LEU99 3.4 18.0 0.2
C A:LEU99 3.4 12.7 0.5
CG A:ASN97 3.5 18.3 0.7
H A:ASP95 3.5 18.0 0.3
C A:LEU99 3.5 13.3 0.2
H A:ASP95 3.5 19.0 0.2
C A:LEU99 3.5 13.1 0.3
H A:LEU99 3.6 18.0 0.5
CG A:ASP93 3.6 13.4 0.3
HA A:ILE100 3.6 12.5 0.5
HA A:ASP93 3.6 15.0 0.4
OD2 A:ASP95 3.6 18.0 0.2
CG A:ASP93 3.6 13.5 0.2
HA A:ASP93 3.7 14.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.7 19.5 0.3
ND2 A:ASN97 3.7 20.1 0.3
H A:SER101 3.8 10.1 0.5
HA A:ASP93 3.8 14.7 0.2
HA A:ILE100 3.8 12.5 0.2
HA A:ILE100 3.9 10.6 0.3
OD2 A:ASP95 3.9 20.8 0.4
H A:SER101 3.9 12.3 0.2
HB2 A:LEU99 4.0 16.7 0.5
HD21 A:ASN97 4.0 24.6 1.0
H A:GLY96 4.0 22.3 0.3
HB2 A:LEU99 4.0 17.8 0.3
HB2 A:LEU99 4.1 17.8 0.2
H A:ARG94 4.1 16.0 0.2
OD2 A:ASP93 4.1 14.0 0.4
H A:GLY96 4.1 22.8 0.2
N A:LEU99 4.1 14.3 0.3
CG A:GLU104 4.1 9.9 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.2
N A:ASN97 4.2 19.4 1.0
ND2 A:ASN97 4.2 20.5 0.7
N A:ASP95 4.2 14.7 0.4
N A:LEU99 4.2 15.0 0.5
H A:SER101 4.2 11.5 0.3
CA A:ASP93 4.2 12.5 0.4
CB A:ASP93 4.2 12.6 0.4
N A:ASP95 4.3 15.8 0.2
N A:ASP95 4.3 15.0 0.3
CA A:LEU99 4.3 14.1 0.2
C A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.6 0.5
CA A:ASP93 4.3 12.2 0.3
CA A:LEU99 4.3 13.4 0.3
H A:GLY96 4.3 20.8 0.4
CA A:ILE100 4.4 10.4 0.5
N A:ILE100 4.4 11.7 0.2
CB A:ASP95 4.4 18.0 0.4
N A:ILE100 4.4 10.1 0.5
C A:ASP93 4.4 12.8 0.4
H A:ARG94 4.4 15.8 0.4
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.3
CB A:ASN97 4.4 21.8 0.3
OD2 A:ASP93 4.4 14.2 0.2
N A:ILE100 4.4 10.7 0.3
N A:SER101 4.4 8.4 0.5
HB3 A:ASP95 4.4 21.6 0.4
H A:GLY98 4.4 21.8 0.3
HB2 A:ASP93 4.5 15.2 0.4
CB A:ASN97 4.5 22.6 0.7
N A:GLY96 4.5 18.6 0.3
N A:ARG94 4.5 13.3 0.2
CG A:GLU104 4.5 9.8 0.6
H A:GLY98 4.5 22.1 0.2
HB3 A:SER101 4.5 12.3 0.2
CA A:ASP93 4.5 12.3 0.2
N A:SER101 4.5 10.2 0.2
CA A:ILE100 4.5 10.4 0.2
HB3 A:ASN97 4.5 27.2 0.7
HG3 A:GLU104 4.5 11.9 0.4
N A:GLY96 4.5 19.0 0.2
H A:GLY98 4.5 21.4 0.5
CB A:ASP95 4.5 16.7 0.3
N A:ARG94 4.5 13.1 0.4
HB3 A:SER101 4.5 13.7 0.5
CB A:ASP93 4.5 12.7 0.3
HB3 A:ASN97 4.5 26.2 0.3
HG2 A:GLU104 4.6 11.9 0.4
CA A:ILE100 4.6 8.8 0.3
CB A:ASP93 4.6 12.9 0.2
CB A:ASP95 4.6 17.5 0.2
N A:GLY96 4.6 17.3 0.4
CB A:LEU99 4.6 13.9 0.5
H A:ARG94 4.6 13.9 0.3
O A:HOH381 4.6 29.5 1.0
CA A:ASP95 4.6 16.3 0.4
O A:ASP93 4.6 13.1 0.3
N A:ARG94 4.6 11.6 0.3
C A:ASP93 4.7 13.4 0.2
CA A:ASN97 4.7 21.7 1.0
HB3 A:SER101 4.7 12.0 0.3
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.2
CB A:LEU99 4.7 14.8 0.3
CA A:ASP95 4.7 17.3 0.3
C A:ASP95 4.7 17.2 0.4
N A:SER101 4.7 9.6 0.3
OG A:SER101 4.7 9.7 0.2
HG3 A:GLU104 4.7 11.7 0.6
CA A:ASP95 4.8 17.9 0.2
HB2 A:ASP93 4.8 15.4 0.2
N A:GLY98 4.8 18.2 0.3
HG A:SER101 4.8 11.7 0.2
HD2 A:HIS135 4.8 14.2 0.2
N A:GLY98 4.8 18.4 0.2
C A:ASP95 4.8 18.3 0.3
HB2 A:GLU104 4.8 10.4 0.4
N A:GLY98 4.8 17.8 0.5
C A:ASP95 4.9 19.2 0.2
HD2 A:HIS135 4.9 15.2 0.3
HB3 A:ASP95 4.9 20.0 0.3
C A:ILE100 4.9 10.3 0.2
HB3 A:LEU99 4.9 16.7 0.5
C A:ILE100 4.9 9.5 0.5
HG2 A:GLU104 4.9 11.7 0.6
O A:ASP93 4.9 12.3 0.4
HD22 A:ASN97 4.9 24.6 1.0
HB2 A:ASP93 5.0 15.2 0.3
HD2 A:HIS135 5.0 18.4 0.2
C A:ASN97 5.0 20.4 1.0

Reference:

J.Lin, H.Van Den Bedem, A.T.Brunger, M.A.Wilson. Atomic Resolution Experimental Phase Information Reveals Extensive Disorder and Bound 2-Methyl-2,4-Pentanediol in Ca(2+)-Calmodulin. Acta Crystallogr D Struct V. 72 83 2016BIOL.
ISSN: ISSN 2059-7983
PubMed: 26894537
DOI: 10.1107/S2059798315021609
Page generated: Wed Jul 9 05:20:31 2025

Last articles

I in 6Z79
I in 6Z6E
I in 6YVG
I in 6YR6
I in 6YRB
I in 6YT2
I in 6YGD
I in 6YGC
I in 6YGA
I in 6YGB
© Copyright 2008-2020 by atomistry.com
Home   |    Site Map   |    Copyright   |    Contact us   |    Privacy